small nuclear ribonucleoprotein 200kDa (U5)

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同義遺伝子名

BRR2 homolog, BRR2, U5-200KD, HELIC2, ASCC3L1, U5 snRNP-specific 200 kDa protein, KIAA0788

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:124.40

小脳:352.60

脳幹:-

脳梁:145.80

松果体:296.70

末梢神経:61.30

脊柱:112.30

網膜:-

目:188.10

動脈:-

静脈:666.50

リンパ節:212.30

末梢血:145.70

脾臓:113.40

胸腺:206.10

骨髄:275.50

脂肪:161.30

骨:140.70

皮膚:273.60

GeneChip

大脳:7.57

小脳:8.06

脳幹:7.55

脳梁:7.80

松果体:-

末梢神経:7.92

脊柱:7.96

網膜:-

目:-

動脈:8.21

静脈:7.88

リンパ節:8.81

末梢血:-

脾臓:8.76

胸腺:9.35

骨髄:8.37

脂肪:8.20

骨:-

皮膚:8.41

CAGE

大脳:4.13

小脳:-

脳幹:4.03

脳梁:4.29

松果体:4.45

末梢神経:-

脊柱:3.96

網膜:-

目:-

動脈:4.25

静脈:4.44

リンパ節:4.30

末梢血:-

脾臓:4.30

胸腺:4.97

骨髄:-

脂肪:4.05

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.83

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:4.49

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:4.43

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:309.80

胎盤:204

前立腺:146.40

卵巣:260.80

精巣:147.10

心臓:191.60

骨格筋:20.10

食道:-

胃:106.20

腸:32.40

結腸:245.90

肝臓:42.20

肺:185.70

膀胱:125.60

腎臓:41.60

下垂体:232

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:142.30

乳腺:223

唾液腺:-

GeneChip

子宮:8.53

胎盤:8.43

前立腺:8.67

卵巣:8.78

精巣:9.07

心臓:7.84

骨格筋:8.15

食道:8.29

胃:8.15

腸:8.06

結腸:8.09

肝臓:8.09

肺:8.18

膀胱:-

腎臓:8.08

下垂体:8.46

甲状腺:8.46

副腎:8.27

膵臓:7.41

乳腺:8.70

唾液腺:8.14

CAGE

子宮:4.47

胎盤:4.52

前立腺:4.23

卵巣:4.63

精巣:4.65

心臓:4.12

骨格筋:4.39

食道:4.06

胃:-

腸:4.18

結腸:4.22

肝臓:4.19

肺:3.97

膀胱:4.30

腎臓:4.01

下垂体:4.29

甲状腺:3.96

副腎:-

膵臓:4.05

乳腺:4.00

唾液腺:4.19

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:4.77

卵巣:5.15

精巣:4.84

心臓:3.67

骨格筋:4.88

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:3.86

肝臓:3.35

肺:3.88

膀胱:-

腎臓:4.13

下垂体:-

甲状腺:4.87

副腎:4.67

膵臓:-

乳腺:3.94

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_014014
Gene ID	23020
Unigene ID	Hs.246112
Probe set ID	200058_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000144028
GTEx ID	ENSG00000144028

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_177214
ラット [0]

染色体

2q11.2 [96,940,074 - 96,971,297]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR014001	DEAD-like helicase, N-terminal
IPR014021	Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain
IPR004179	Sec63 domain

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0000354	cis assembly of pre-catalytic spliceosome
GO:0010467	gene expression
GO:0000398	nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0008380	RNA splicing

Cellular Component

GO:0071013	catalytic step 2 spliceosome
GO:0005730	nucleolus
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0005681	spliceosomal complex
GO:0005682	U5 snRNP

Molecular Function

GO:0005524	ATP binding
GO:0008026	ATP-dependent helicase activity
GO:0004004	ATP-dependent RNA helicase activity
GO:0003676	nucleic acid binding
GO:0005515	protein binding

small nuclear ribonucleoprotein 200kDa (U5)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function