lysine (K)-specific demethylase 1A

同義遺伝子名

LSD1, BRAF35-HDAC complex protein BHC110, BHC110, KIAA0601, amine oxidase (flavin containing) domain 2, Lysine-specific histone demethylase 1, AOF2

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

nodata

GeneChip

大脳:7.29

小脳:7.52

脳幹:7.34

脳梁:7.02

松果体:-

末梢神経:7.13

脊柱:7

網膜:-

目:-

動脈:7.11

静脈:7.03

リンパ節:7.07

末梢血:-

脾臓:6.87

胸腺:7.92

骨髄:7.19

脂肪:7.23

骨:-

皮膚:7.39

CAGE

大脳:3.78

小脳:-

脳幹:3.52

脳梁:3.53

松果体:3.67

末梢神経:-

脊柱:3.18

網膜:-

目:-

動脈:3.56

静脈:3.79

リンパ節:3.40

末梢血:-

脾臓:3.42

胸腺:4.48

骨髄:-

脂肪:3.56

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:1.78

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:1.52

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.28

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

nodata

GeneChip

子宮:7.65

胎盤:7.22

前立腺:7.63

卵巣:7.95

精巣:9.18

心臓:7.19

骨格筋:7.72

食道:7.42

胃:7.16

腸:7.43

結腸:7.46

肝臓:6.77

肺:7.18

膀胱:-

腎臓:7.19

下垂体:7.80

甲状腺:7.32

副腎:7.32

膵臓:7.27

乳腺:7.48

唾液腺:7.31

CAGE

子宮:4.06

胎盤:3.46

前立腺:3.81

卵巣:3.91

精巣:5.07

心臓:3.64

骨格筋:3.92

食道:3.64

胃:-

腸:3.49

結腸:3.79

肝臓:3.34

肺:3.36

膀胱:3.72

腎臓:3.46

下垂体:4.18

甲状腺:3.77

副腎:-

膵臓:3.61

乳腺:3.22

唾液腺:3.74

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.92

卵巣:3.07

精巣:3.95

心臓:1.71

骨格筋:2.54

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.38

肝臓:0.89

肺:1.35

膀胱:-

腎臓:2.42

下垂体:-

甲状腺:3.19

副腎:2.38

膵臓:-

乳腺:2.10

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001009999
Gene ID	23028
Unigene ID	-
Probe set ID	212348_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000004487
GTEx ID	ENSG00000004487

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_133872
ラット[1]	NM_001130098

染色体

1p36.12 [23,345,941 - 23,410,182]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007596	blood coagulation
GO:0008283	cell proliferation
GO:0030851	granulocyte differentiation
GO:0034720	histone H3-K4 demethylation
GO:0033169	histone H3-K9 demethylation
GO:0001701	in utero embryonic development
GO:0055001	muscle cell development
GO:0043392	negative regulation of DNA binding
GO:0043518	negative regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator
GO:0051572	negative regulation of histone H3-K4 methylation
GO:0051573	negative regulation of histone H3-K9 methylation
GO:0032091	negative regulation of protein binding
GO:0043433	negative regulation of transcription factor activity
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045892	negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0021983	pituitary gland development
GO:0045648	positive regulation of erythrocyte differentiation
GO:0046886	positive regulation of hormone biosynthetic process
GO:0045654	positive regulation of megakaryocyte differentiation
GO:0051091	positive regulation of transcription factor activity
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006482	protein amino acid demethylation
GO:0010725	regulation of primitive erythrocyte differentiation
GO:0006357	regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0000790	nuclear chromatin
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0005667	transcription factor complex

Molecular Function

GO:0050681	androgen receptor binding
GO:0003682	chromatin binding
GO:0032451	demethylase activity
GO:0044212	DNA regulatory region binding
GO:0019899	enzyme binding
GO:0050660	FAD binding
GO:0032452	histone demethylase activity
GO:0034648	histone demethylase activity (H3-dimethyl-K4 specific)
GO:0032453	histone demethylase activity (H3-K4 specific)
GO:0032454	histone demethylase activity (H3-K9 specific)
GO:0030374	ligand-dependent nuclear receptor transcription coactivator activity
GO:0043426	MRF binding
GO:0016491	oxidoreductase activity
GO:0002039	p53 binding
GO:0005515	protein binding
GO:0003700	transcription factor activity
GO:0008134	transcription factor binding

lysine (K)-specific demethylase 1A

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function