sterile alpha and TIR motif containing 1

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同義遺伝子名

Tir-1 homolog, SAMD2, sterile alpha and TIR motif containing 1, Sterile alpha and Armadillo repeat protein, FLJ36296, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, SARM1, KIAA0524, SARM

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:6.60 小脳:6.99 脳幹:6.42 脳梁:6.74 松果体:- 末梢神経:7.12 脊柱:6.53 網膜:- 目:- 動脈:6.42 静脈:6.48 リンパ節:6.67 末梢血:- 脾臓:6.68 胸腺:5.75 骨髄:6.42 脂肪:6.45 骨:- 皮膚:6.34
CAGE 大脳:3.32 小脳:- 脳幹:2.70 脳梁:3.24 松果体:3.41 末梢神経:- 脊柱:3.36 網膜:- 目:- 動脈:3.52 静脈:2.79 リンパ節:3.32 末梢血:- 脾臓:2.89 胸腺:1.88 骨髄:- 脂肪:2.64 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.09 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.36 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.98 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:6.54 胎盤:6.24 前立腺:6.49 卵巣:6.73 精巣:5.95 心臓:6.45 骨格筋:6.31 食道:6.34 胃:6.77 腸:6.75 結腸:6.75 肝臓:6.37 肺:6.41 膀胱:- 腎臓:6.84 下垂体:6.88 甲状腺:6.94 副腎:6.74 膵臓:6.92 乳腺:6.56 唾液腺:6.96
CAGE 子宮:3.25 胎盤:1.92 前立腺:3.02 卵巣:2.96 精巣:2.67 心臓:2.79 骨格筋:1.72 食道:2.41 胃:- 腸:2.44 結腸:2.96     肝臓:2.50    肺:2.85 膀胱:2.87 腎臓:2.63 下垂体:3.59 甲状腺:2.56 副腎:- 膵臓:3.73 乳腺:3.09 唾液腺:3.11
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.66 卵巣:1.84 精巣:1.00 心臓:0.60 骨格筋:0.05 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.91     肝臓:0.41        肺:0.66    膀胱:- 腎臓:1.56 下垂体:- 甲状腺:1.52 副腎:1.48 膵臓:- 乳腺:0.88 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_015077
Gene ID 23098
Unigene ID -
Probe set ID 213257_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000004139
GTEx ID ENSG00000004139

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_001168521, NM_172795
ラット[1]  NM_001105817, NM_172795

染色体

17q11.2  [26,691,378  -  26,728,046]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001660  Sterile alpha motif
IPR010993  Sterile alpha motif homology
IPR013761  Sterile alpha motif-type
IPR000157  Toll-Interleukin receptor

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9628581
11386760
12477932
14702039
15123841
15893701
16964262
17258210
17804407
18089857
19913121
20306472
20628086
21048031
21139048
21890473
21903422
22145856
22797925
23175186
23885119
24021647
24250222
24457600
24840802

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0045087  innate immune response
GO:0002756  MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway
GO:0048814  regulation of dendrite morphogenesis
GO:0034138  toll-like receptor 3 signaling pathway
GO:0034142  toll-like receptor 4 signaling pathway
GO:0002224  toll-like receptor signaling pathway

Cellular Component

GO:0030424  axon
GO:0030054  cell junction
GO:0005737  cytoplasm
GO:0005829  cytosol
GO:0030425  dendrite
GO:0005874  microtubule
GO:0005739  mitochondrion
GO:0045202  synapse