spastic paraplegia 20 (Troyer syndrome)

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同義遺伝子名

SPG20, TAHCCP1, KIAA0610, SPARTIN, Spartin, spastic paraplegia 20, spartin (Troyer syndrome)

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:136.30

小脳:113.30

脳幹:-

脳梁:262.50

松果体:-

末梢神経:61.30

脊柱:112.30

網膜:237.30

目:276.20

動脈:329.70

静脈:-

リンパ節:20.20

末梢血:91.10

脾臓:94.50

胸腺:77.30

骨髄:39.40

脂肪:40.30

骨:25.60

皮膚:76.80

GeneChip

大脳:7.27

小脳:6.70

脳幹:7.56

脳梁:7.80

松果体:-

末梢神経:7.33

脊柱:7.89

網膜:-

目:-

動脈:7

静脈:7.07

リンパ節:5.94

末梢血:-

脾臓:7

胸腺:6.79

骨髄:7.01

脂肪:7.03

骨:-

皮膚:6.58

CAGE

大脳:4.56

小脳:-

脳幹:4.75

脳梁:4.62

松果体:5.25

末梢神経:-

脊柱:5.23

網膜:-

目:-

動脈:4.53

静脈:3.88

リンパ節:3.62

末梢血:-

脾臓:4.25

胸腺:3.33

骨髄:-

脂肪:4.67

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.90

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.92

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.64

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:145.80

胎盤:116.60

前立腺:56.30

卵巣:74.50

精巣:69.20

心臓:38.30

骨格筋:20.10

食道:-

胃:63.70

腸:32.40

結腸:-

肝臓:84.40

肺:107.50

膀胱:125.60

腎臓:104

下垂体:232

甲状腺:-

副腎:101.60

膵臓:62.20

乳腺:83.60

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.81

胎盤:7.90

前立腺:7.52

卵巣:7.94

精巣:6.98

心臓:6.86

骨格筋:6.73

食道:6.09

胃:6.49

腸:6.69

結腸:5.72

肝臓:5.04

肺:6.79

膀胱:-

腎臓:6.76

下垂体:7.14

甲状腺:7

副腎:7.59

膵臓:5.53

乳腺:6.74

唾液腺:5.87

CAGE

子宮:4.69

胎盤:4.82

前立腺:4.78

卵巣:4.89

精巣:4.41

心臓:4.48

骨格筋:4.01

食道:4.33

胃:-

腸:3.51

結腸:3.80

肝臓:2.84

肺:4.39

膀胱:4.89

腎臓:4.52

下垂体:4.77

甲状腺:4.42

副腎:-

膵臓:2.66

乳腺:5.26

唾液腺:3.59

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.44

卵巣:2.65

精巣:2.80

心臓:1.90

骨格筋:2.22

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:3.09

肝臓:0.46

肺:2.89

膀胱:-

腎臓:1.84

下垂体:-

甲状腺:2.81

副腎:1.82

膵臓:-

乳腺:2.52

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_015087
Gene ID	23111
Unigene ID	Hs.440414
Probe set ID	212526_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000133104
GTEx ID	ENSG00000133104

オーソログ対応遺伝子

マウス[9]	NM_001144987, NM_001144988, NM_144895
ラット[1]	NM_001106433, NM_001144988, NM_144895

染色体

13q13.3 [36,875,775 - 36,944,317]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

GO:0009838	abscission
GO:0060612	adipose tissue development
GO:0008219	cell death
GO:0051301	cell division
GO:0000910	cytokinesis
GO:0034389	lipid particle organization
GO:0030514	negative regulation of BMP signaling pathway
GO:0048698	negative regulation of collateral sprouting in the absence of injury
GO:0050905	neuromuscular process
GO:0051881	regulation of mitochondrial membrane potential

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005811	lipid particle
GO:0030496	midbody
GO:0005741	mitochondrial outer membrane
GO:0045202	synapse

GO:0005515	protein binding
GO:0031625	ubiquitin protein ligase binding

spastic paraplegia 20 (Troyer syndrome)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function