pogo transposable element with ZNF domain

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同義遺伝子名

POGZ, pogo transposable element with ZNF domain, SUHW5, MGC71543, KIAA0461, Nbla00003, Pogo transposable element with ZNF domain, ZNF635

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:- 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip 大脳:8.56 小脳:9.32 脳幹:8.44 脳梁:8.99 松果体:- 末梢神経:8.39 脊柱:8.55 網膜:- 目:- 動脈:8.52 静脈:8.23 リンパ節:8.45 末梢血:- 脾臓:8.65 胸腺:8.64 骨髄:8.28 脂肪:8.22 骨:- 皮膚:8.16
CAGE 大脳:3.23 小脳:- 脳幹:3.10 脳梁:3.25 松果体:3.47 末梢神経:- 脊柱:2.98 網膜:- 目:- 動脈:3.27 静脈:3.24 リンパ節:3.04 末梢血:- 脾臓:3.08 胸腺:3.52 骨髄:- 脂肪:3.15 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.22 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.40 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.51 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:4.30 心臓:12.80 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:8.98 胎盤:8.13 前立腺:8.66 卵巣:9.05 精巣:8.18 心臓:8.05 骨格筋:7.87 食道:8.03 胃:8.48 腸:8.16 結腸:8.11 肝臓:8.09 肺:8.71 膀胱:- 腎臓:8.39 下垂体:8.84 甲状腺:8.87 副腎:8.63 膵臓:6.92 乳腺:8.76 唾液腺:8.09
CAGE 子宮:3.54 胎盤:2.85 前立腺:3.23 卵巣:3.42 精巣:3.55 心臓:2.86 骨格筋:2.43 食道:2.67 胃:- 腸:2.82 結腸:3.19     肝臓:2.46    肺:3.10 膀胱:3.03 腎臓:2.72 下垂体:3.39 甲状腺:3.15 副腎:- 膵臓:2.90 乳腺:3.30 唾液腺:2.80
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.19 卵巣:1.36 精巣:0.04 心臓:1.14 骨格筋:1.53 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.02     肝臓:0.00        肺:0.47    膀胱:- 腎臓:0.00 下垂体:- 甲状腺:1.59 副腎:0.08 膵臓:- 乳腺:1.34 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_015100
Gene ID 23126
Unigene ID Hs.489873
Probe set ID 212153_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000143442
GTEx ID ENSG00000143442

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_001165948, NM_172683
ラット[1]  NM_001107693, NM_172683

染色体

1q21.3  [151,375,200  -  151,431,941]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR006600  Pogo transposase / Cenp-B / PDC2, DNA-binding HTH domain
IPR015880  Zinc finger, C2H2-like
IPR007087  Zinc finger, C2H2-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9455484
10976766
11076863
11230166
12477932
12880961
15302935
15489334
15489336
16381901
16710414
17081983
18029348
18654987
19244240
19394292
20360068
20379614
20562864
20936779
21139048
21252943
21832049
21888893
21890473
22094256
22586326
22990118
23000965
23720494
24457600

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0051301  cell division
GO:0051382  kinetochore assembly
GO:0007064  mitotic sister chromatid cohesion

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0000790  nuclear chromatin
GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0003677  DNA binding
GO:0046872  metal ion binding
GO:0005515  protein binding