PHD finger protein 8

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同義遺伝子名

PHD finger protein 8, PHF8, MRXSSD, DKFZp686E0868, KIAA1111, ZNF422

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:23.70 小脳:25.20 脳幹:- 脳梁:29.20 松果体:- 末梢神経:92 脊柱:- 網膜:118.60 目:35.30 動脈:- 静脈:199.90 リンパ節:111.20 末梢血:- 脾臓:18.90 胸腺:64.40 骨髄:39.40 脂肪:- 骨:- 皮膚:28.80
GeneChip 大脳:6.03 小脳:6.34 脳幹:5.89 脳梁:6.40 松果体:- 末梢神経:6.21 脊柱:6.09 網膜:- 目:- 動脈:6.36 静脈:6.10 リンパ節:6.73 末梢血:- 脾臓:6.72 胸腺:6.88 骨髄:6.50 脂肪:6.35 骨:- 皮膚:6.22
CAGE 大脳:2.67 小脳:- 脳幹:2.71 脳梁:3.12 松果体:2.95 末梢神経:- 脊柱:2.79 網膜:- 目:- 動脈:3.05 静脈:2.74 リンパ節:2.94 末梢血:- 脾臓:2.79 胸腺:3.31 骨髄:- 脂肪:2.66 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.63 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.66 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.80 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:9.10 胎盤:54.60 前立腺:33.80 卵巣:37.30 精巣:173.10 心臓:12.80 骨格筋:- 食道:- 胃:63.70 腸:- 結腸:76.30     肝臓:10.60        肺:29.30    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:50.80 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.45 胎盤:6.90 前立腺:6.81 卵巣:6.64 精巣:7.52 心臓:6.06 骨格筋:6.08 食道:6.19 胃:6.32 腸:6.06 結腸:6.29 肝臓:7.11 肺:6.38 膀胱:- 腎臓:6.62 下垂体:6.81 甲状腺:6.61 副腎:6.20 膵臓:5.85 乳腺:6.81 唾液腺:6.14
CAGE 子宮:2.94 胎盤:2.61 前立腺:2.89 卵巣:2.66 精巣:3.88 心臓:2.45 骨格筋:2.07 食道:2.63 胃:- 腸:2.60 結腸:2.86     肝臓:3.02    肺:2.71 膀胱:2.73 腎臓:2.73 下垂体:3.22 甲状腺:2.71 副腎:- 膵臓:2.66 乳腺:2.91 唾液腺:2.83
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.38 卵巣:0.00 精巣:0.61 心臓:0.13 骨格筋:0.00 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.62     肝臓:0.00        肺:1.09    膀胱:- 腎臓:0.00 下垂体:- 甲状腺:2.04 副腎:0.89 膵臓:- 乳腺:1.35 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_015107
Gene ID 23133
Unigene ID Hs.133352
Probe set ID 212916_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000172943
GTEx ID ENSG00000172943

オーソログ対応遺伝子

マウス[3]  NM_001009544, NM_001113354, NM_177201
ラット[1]  NM_001108253, NM_001106765, NM_177201

染色体

Xp11.22  [53,963,109  -  54,075,391]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003347  Transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase
IPR019787  Zinc finger, PHD-finger
IPR001965  Zinc finger, PHD-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10398231
10470851
12168954
12477932
14702039
15199551
15302935
15489334
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16199551
16344560
17081983
17594395
17643375
17661819
18498374
19394292
19596686
19843542
20023638
20067792
20101266
20208542
20346720
20421419
20467438
20531378
20548336
20622853
20622854
20644565
20953165
21029866
21057379
21139048
21832049
21963094
22120715
22505724
22850744
23022380
23518351
23979597
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007420  brain development
GO:0000082  G1/S transition of mitotic cell cycle
GO:0070544  histone H3-K36 demethylation
GO:0033169  histone H3-K9 demethylation
GO:0045943  positive regulation of transcription from RNA polymerase I promoter
GO:0045893  positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0003682  chromatin binding
GO:0032452  histone demethylase activity
GO:0051864  histone demethylase activity (H3-K36 specific)
GO:0032454  histone demethylase activity (H3-K9 specific)
GO:0005506  iron ion binding
GO:0035064  methylated histone residue binding
GO:0016706  oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, 2-oxoglutarate as one donor, and incorporation of one atom each of oxygen into both donors
GO:0016702  oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen
GO:0005515  protein binding
GO:0008270  zinc ion binding