SATB homeobox 2

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

Special AT-rich sequence-binding protein 2, SATB family member 2, DNA-binding protein SATB2, FLJ21474, MGC119477, MGC119474, FLJ32076, KIAA1034, SATB2

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:107.80 小脳:- 脳幹:- 脳梁:29.20 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:17.60 動脈:- 静脈:- リンパ節:10.10 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:76.80 皮膚:9.60
GeneChip 大脳:5.78 小脳:3.96 脳幹:4.58 脳梁:5.32 松果体:- 末梢神経:4.68 脊柱:6.06 網膜:- 目:- 動脈:4.43 静脈:4.30 リンパ節:4.30 末梢血:- 脾臓:4.11 胸腺:4.23 骨髄:4.28 脂肪:4.57 骨:- 皮膚:4.59
CAGE 大脳:2.17 小脳:- 脳幹:0.84 脳梁:0.99 松果体:0.62 末梢神経:- 脊柱:1.42 網膜:- 目:- 動脈:1.48 静脈:0.59 リンパ節:0.71 末梢血:- 脾臓:0.09 胸腺:0.12 骨髄:- 脂肪:1.12 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.82 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.80 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.18 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:3.60 前立腺:11.30 卵巣:74.50 精巣:26 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:42.50 腸:- 結腸:279.80     肝臓:10.60        肺:-    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:50.80 膵臓:- 乳腺:37.20 唾液腺:-
GeneChip 子宮:5.04 胎盤:4.11 前立腺:5.21 卵巣:4.30 精巣:4.93 心臓:4.07 骨格筋:4.34 食道:4.20 胃:4.07 腸:4.44 結腸:7.75 肝臓:4.64 肺:4.30 膀胱:- 腎臓:5.59 下垂体:4.12 甲状腺:4.28 副腎:5.53 膵臓:4.47 乳腺:4.99 唾液腺:4.23
CAGE 子宮:1.36 胎盤:0.08 前立腺:0.78 卵巣:0.47 精巣:1.30 心臓:0.34 骨格筋:1.03 食道:0.52 胃:- 腸:2.13 結腸:3.62     肝臓:1.12    肺:0.05 膀胱:0.58 腎臓:1.72 下垂体:0.42 甲状腺:0.32 副腎:- 膵臓:1.21 乳腺:1.16 唾液腺:0.36
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.03 卵巣:0.67 精巣:1.42 心臓:0.01 骨格筋:0.80 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.05     肝臓:0.61        肺:0.21    膀胱:- 腎臓:1.27 下垂体:- 甲状腺:0.06 副腎:0.04 膵臓:- 乳腺:0.78 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_015265
Gene ID 23314
Unigene ID Hs.516617
Probe set ID 213435_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000119042
GTEx ID ENSG00000119042

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_139146
ラット [0]  

染色体

2q33.1  [200,134,223  -  200,335,989]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001356  Homeobox
IPR009057  Homeodomain-like
IPR012287  Homeodomain-related

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10470851
10964520
12477932
12915443
14701874
14702039
15489334
16327884
16953426
17377962
18029348
18333962
19322201
19668335
19937600
20228799
20308991
20634891
20829881
21343628
21677534
21890473
21965674
22570222
22815795
22825848
23701429
23728906
23925499
23966867
24565840

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0051216  cartilage development
GO:0071310  cellular response to organic substance
GO:0006338  chromatin remodeling
GO:0009880  embryonic pattern specification
GO:0048704  embryonic skeletal system morphogenesis
GO:0000122  negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0001764  neuron migration
GO:0002076  osteoblast development
GO:0060021  palate development
GO:0045944  positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0000118  histone deacetylase complex
GO:0016363  nuclear matrix
GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus
GO:0005667  transcription factor complex

Molecular Function

GO:0003682  chromatin binding
GO:0043565  sequence-specific DNA binding
GO:0003700  transcription factor activity