single stranded DNA binding protein 3

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

CSDP, single stranded DNA binding protein 3, SSDP1, Single-stranded DNA-binding protein 3, SSDP, FLJ10355, SSBP3, single-stranded DNA-binding protein 3

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:6.84 小脳:6.96 脳幹:6.56 脳梁:6.71 松果体:- 末梢神経:6.96 脊柱:6.59 網膜:- 目:- 動脈:6.62 静脈:6.68 リンパ節:6.48 末梢血:- 脾臓:6.58 胸腺:6.94 骨髄:6.73 脂肪:6.48 骨:- 皮膚:6.04
CAGE 大脳:3.58 小脳:- 脳幹:3.29 脳梁:3.34 松果体:3.75 末梢神経:- 脊柱:2.87 網膜:- 目:- 動脈:3.50 静脈:3.17 リンパ節:2.69 末梢血:- 脾臓:3.14 胸腺:4.34 骨髄:- 脂肪:3.34 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.00 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.00 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.00 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:6.64 胎盤:5.72 前立腺:6.53 卵巣:6.59 精巣:6.68 心臓:6.40 骨格筋:5.95 食道:6.52 胃:6.87 腸:6.10 結腸:6.68 肝臓:6.76 肺:6.17 膀胱:- 腎臓:6.63 下垂体:6.84 甲状腺:6.27 副腎:6.74 膵臓:5.73 乳腺:6.45 唾液腺:6.39
CAGE 子宮:3.97 胎盤:3.14 前立腺:3.70 卵巣:4.01 精巣:3.41 心臓:3.29 骨格筋:2.92 食道:3.33 胃:- 腸:3.33 結腸:3.70     肝臓:3.36    肺:3.05 膀胱:3.61 腎臓:3.01 下垂体:2.63 甲状腺:3.13 副腎:- 膵臓:2.90 乳腺:2.79 唾液腺:3.26
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.00 卵巣:0.11 精巣:0.55 心臓:0.15 骨格筋:0.00 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.00     肝臓:0.00        肺:0    膀胱:- 腎臓:0.00 下垂体:- 甲状腺:0.00 副腎:0.25 膵臓:- 乳腺:0.00 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_145716
Gene ID 23648
Unigene ID -
Probe set ID 217991_x_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000157216
GTEx ID ENSG00000157216

オーソログ対応遺伝子

マウス[6]  NM_023672, NM_198438
ラット[1]  NM_053358, NM_198438

染色体

1p32.3  [54,692,190  -  54,879,152]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR006594  LisH dimerisation motif

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7566098
10524251
12079286
12381786
12477932
14702039
15489334
16325762
16407974
17207965
18080319
19497860
20211142
20379614
20603019
21832049
21906983
23275444
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0060323  head morphogenesis
GO:0021547  midbrain-hindbrain boundary initiation
GO:0043066  negative regulation of apoptosis
GO:0008284  positive regulation of cell proliferation
GO:0045944  positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0021501  prechordal plate formation
GO:0006461  protein complex assembly
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005634  nucleus
GO:0043234  protein complex

Molecular Function

GO:0003697  single-stranded DNA binding