LSM5 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)

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同義遺伝子名

U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, FLJ12710, LSM5, YER146W

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:10.70 小脳:- 脳幹:- 脳梁:29.20 松果体:- 末梢神経:92 脊柱:- 網膜:- 目:23.50 動脈:60 静脈:- リンパ節:10.10 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:40.30 骨:- 皮膚:48
GeneChip 大脳:6.66 小脳:6.35 脳幹:6.86 脳梁:6.84 松果体:- 末梢神経:7.09 脊柱:7.09 網膜:- 目:- 動脈:7.25 静脈:7.48 リンパ節:8.13 末梢血:- 脾臓:7.71 胸腺:9.46 骨髄:8.26 脂肪:7.72 骨:- 皮膚:8.01
CAGE 大脳:3.00 小脳:- 脳幹:2.86 脳梁:2.68 松果体:2.84 末梢神経:- 脊柱:3.14 網膜:- 目:- 動脈:2.92 静脈:2.69 リンパ節:2.97 末梢血:- 脾臓:2.71 胸腺:3.24 骨髄:- 脂肪:2.38 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.80 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.07 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.39 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:63.80 胎盤:18.20 前立腺:45.10 卵巣:- 精巣:34.60 心臓:114.90 骨格筋:20.10 食道:- 胃:21.20 腸:32.40 結腸:-     肝臓:42.20        肺:14.70    膀胱:- 腎臓:52 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:17.80 乳腺:46.50 唾液腺:-
GeneChip 子宮:8.02 胎盤:7.14 前立腺:8.21 卵巣:8.13 精巣:7.54 心臓:7.68 骨格筋:7.41 食道:7.65 胃:7.83 腸:8.05 結腸:7.94 肝臓:7.47 肺:7.16 膀胱:- 腎臓:7.41 下垂体:7.50 甲状腺:8.20 副腎:7.59 膵臓:8.53 乳腺:7.96 唾液腺:7.88
CAGE 子宮:2.88 胎盤:2.42 前立腺:2.73 卵巣:2.78 精巣:2.87 心臓:2.96 骨格筋:2.62 食道:2.92 胃:- 腸:2.93 結腸:2.75     肝臓:3.05    肺:2.89 膀胱:2.42 腎臓:2.94 下垂体:3.26 甲状腺:2.70 副腎:- 膵臓:3.40 乳腺:2.27 唾液腺:3.24
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.40 卵巣:3.31 精巣:3.19 心臓:3.15 骨格筋:2.42 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:3.44     肝臓:3.31        肺:2.68    膀胱:- 腎臓:2.87 下垂体:- 甲状腺:2.92 副腎:3.45 膵臓:- 乳腺:3.16 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_012322
Gene ID 23658
Unigene ID Hs.424908
Probe set ID 211747_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000106355
GTEx ID ENSG00000106355

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_025520
ラット [0]  

染色体

7p14.3  [32,524,951  -  32,534,895]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001163  Like-Sm ribonucleoprotein (LSM) domain
IPR006649  Like-Sm ribonucleoprotein (LSM) domain, eukaryotic/archaea-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10369684
10523320
10851237
11591653
11920408
12477932
12515382
12690205
14702039
15231747
15489334
16341674
16344560
17207965
21139048
21890473
22365833
22505724
22939629
23362303
23824909
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0043928  exonucleolytic nuclear-transcribed mRNA catabolic process involved in deadenylation-dependent decay
GO:0010467  gene expression
GO:0016071  mRNA metabolic process
GO:0006397  mRNA processing
GO:0000288  nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay
GO:0016070  RNA metabolic process
GO:0008380  RNA splicing

Cellular Component

GO:0005829  cytosol
GO:0005634  nucleus
GO:0005681  spliceosomal complex

Molecular Function

GO:0005515  protein binding
GO:0003723  RNA binding