cell adhesion molecule 1

同義遺伝子名

SYNCAM1, SYNCAM, IGSF4A, tumor suppressor in lung cancer 1, sTSLC-1, immunoglobulin superfamily, member 4, BL2, Necl-2, IGSF4, DKFZp686F1789, ST17, NECL2, synCAM1, TSLC1, RA175

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:163.60

小脳:176.30

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:741.70

末梢神経:398.70

脊柱:336.90

網膜:1305

目:476

動脈:-

静脈:-

リンパ節:30.30

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:38.70

骨髄:19.70

脂肪:-

骨:51.20

皮膚:115.20

GeneChip

大脳:7.83

小脳:8.93

脳幹:7.87

脳梁:7.76

松果体:-

末梢神経:8.30

脊柱:7.21

網膜:-

目:-

動脈:5.86

静脈:5.60

リンパ節:5.86

末梢血:-

脾臓:5.83

胸腺:5.22

骨髄:5.07

脂肪:5.74

骨:-

皮膚:5.94

CAGE

大脳:4.83

小脳:-

脳幹:4.76

脳梁:4.64

松果体:6.68

末梢神経:-

脊柱:4.48

網膜:-

目:-

動脈:2.91

静脈:2.69

リンパ節:2.78

末梢血:-

脾臓:2.54

胸腺:2.33

骨髄:-

脂肪:2.87

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.72

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.03

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.00

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:18.20

胎盤:36.40

前立腺:67.60

卵巣:-

精巣:160.10

心臓:114.90

骨格筋:80.40

食道:-

胃:-

腸:32.40

結腸:17

肝臓:42.20

肺:117.30

膀胱:-

腎臓:114.40

下垂体:232

甲状腺:163.70

副腎:50.80

膵臓:151.10

乳腺:83.60

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.60

胎盤:6.69

前立腺:6.53

卵巣:6.77

精巣:7.49

心臓:6.38

骨格筋:5.97

食道:5.61

胃:6.40

腸:6.11

結腸:5.87

肝臓:7.03

肺:7.83

膀胱:-

腎臓:7.21

下垂体:8.32

甲状腺:7.98

副腎:6.96

膵臓:6.23

乳腺:6.06

唾液腺:7.02

CAGE

子宮:3.29

胎盤:3.95

前立腺:3.51

卵巣:3.18

精巣:4.62

心臓:3.36

骨格筋:2.02

食道:2.87

胃:-

腸:3.07

結腸:2.73

肝臓:4.25

肺:4.77

膀胱:3.17

腎臓:3.85

下垂体:4.74

甲状腺:4.94

副腎:-

膵臓:3.02

乳腺:2.79

唾液腺:4.70

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.68

卵巣:0.81

精巣:3.17

心臓:2.37

骨格筋:1.37

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.67

肝臓:0.00

肺:0.71

膀胱:-

腎臓:0.00

下垂体:-

甲状腺:2.84

副腎:0.49

膵臓:-

乳腺:0.18

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001098517
Gene ID	23705
Unigene ID	Hs.370510
Probe set ID	209032_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000182985
GTEx ID	ENSG00000182985

オーソログ対応遺伝子

マウス[12]	NM_001025600, NM_018770, NM_207675, NM_207676
ラット [0]

染色体

11q23.3 [115,039,938 - 115,375,675]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0050798	activated T cell proliferation
GO:0034332	adherens junction organization
GO:0006915	apoptosis
GO:0060348	bone development
GO:0007420	brain development
GO:0016338	calcium-independent cell-cell adhesion
GO:0030154	cell differentiation
GO:0034329	cell junction assembly
GO:0008037	cell recognition
GO:0045216	cell-cell junction organization
GO:0051606	detection of stimulus
GO:0007157	heterophilic cell adhesion
GO:0007156	homophilic cell adhesion
GO:0001889	liver development
GO:0050715	positive regulation of cytokine secretion
GO:0045954	positive regulation of natural killer cell mediated cytotoxicity
GO:0007283	spermatogenesis
GO:0042271	susceptibility to natural killer cell mediated cytotoxicity
GO:0007416	synapse assembly
GO:0001913	T cell mediated cytotoxicity
GO:0009826	unidimensional cell growth

Cellular Component

GO:0030424	axon
GO:0016323	basolateral plasma membrane
GO:0005911	cell-cell junction
GO:0030425	dendrite
GO:0016021	integral to membrane
GO:0005886	plasma membrane
GO:0008021	synaptic vesicle

Molecular Function

GO:0050839	cell adhesion molecule binding
GO:0030165	PDZ domain binding
GO:0005515	protein binding
GO:0008022	protein C-terminus binding
GO:0042803	protein homodimerization activity
GO:0005102	receptor binding

cell adhesion molecule 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function