X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 6

同義遺伝子名

TLAA, Lupus Ku autoantigen protein p70, CTC box-binding factor 75 kDa subunit, ATP-dependent DNA helicase II 70 kDa subunit, ATP-dependent DNA helicase 2 subunit 1, DNA-repair protein XRCC6, thyroid autoantigen 70kD (Ku antigen), Thyroid-lupus autoantigen, D22S671, G22P1, CTCBF, D22S731, Ku70, CTC75, ML8, thyroid autoantigen 70kDa (Ku antigen), 70 kDa subunit of Ku antigen, KU70, XRCC6

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:546.40

小脳:843.80

脳幹:-

脳梁:1662.20

松果体:148.30

末梢神経:337.40

脊柱:449.20

網膜:118.60

目:264.50

動脈:1888.40

静脈:1266.30

リンパ節:384.20

末梢血:1166

脾臓:945.30

胸腺:1262.60

骨髄:255.80

脂肪:766.30

骨:985.20

皮膚:470.40

GeneChip

大脳:9.31

小脳:9.43

脳幹:9.45

脳梁:9.13

松果体:-

末梢神経:9.70

脊柱:9.31

網膜:-

目:-

動脈:9.64

静脈:9.63

リンパ節:9.68

末梢血:-

脾臓:9.42

胸腺:10.10

骨髄:9.43

脂肪:9.57

骨:-

皮膚:9.87

CAGE

大脳:4.86

小脳:-

脳幹:4.56

脳梁:4.53

松果体:5.41

末梢神経:-

脊柱:5.11

網膜:-

目:-

動脈:4.81

静脈:4.52

リンパ節:4.91

末梢血:-

脾臓:4.76

胸腺:5.04

骨髄:-

脂肪:4.70

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:6.19

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:5.78

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:6.28

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:637.90

胎盤:601.10

前立腺:439.30

卵巣:149.10

精巣:1107.60

心臓:459.80

骨格筋:502.30

食道:342.80

胃:403.60

腸:1490.30

結腸:347.70

肝臓:179.40

肺:376.30

膀胱:2637.90

腎臓:343.10

下垂体:-

甲状腺:1801.20

副腎:2133.10

膵臓:186.70

乳腺:195.20

唾液腺:-

GeneChip

子宮:9.87

胎盤:9.49

前立腺:9.92

卵巣:10.10

精巣:11.22

心臓:9.38

骨格筋:9.50

食道:10.09

胃:9.29

腸:9.45

結腸:9.57

肝臓:8.96

肺:9.57

膀胱:-

腎臓:9.28

下垂体:9.69

甲状腺:9.61

副腎:9.72

膵臓:8.91

乳腺:9.80

唾液腺:9.31

CAGE

子宮:4.72

胎盤:4.85

前立腺:4.58

卵巣:4.80

精巣:5.53

心臓:4.79

骨格筋:5.25

食道:4.79

胃:-

腸:4.58

結腸:4.48

肝臓:4.68

肺:4.72

膀胱:4.60

腎臓:4.69

下垂体:5.10

甲状腺:4.63

副腎:-

膵臓:4.58

乳腺:4.44

唾液腺:4.93

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:6.33

卵巣:6.73

精巣:7.36

心臓:5.49

骨格筋:6.28

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:6.29

肝臓:5.15

肺:6.37

膀胱:-

腎臓:6.06

下垂体:-

甲状腺:6.74

副腎:6.44

膵臓:-

乳腺:5.99

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001469
Gene ID	2547
Unigene ID	Hs.292493
Probe set ID	200792_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000196419
GTEx ID	ENSG00000196419

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_010247
ラット[1]	NM_139080

染色体

22q13.2 [42,017,123 - 42,060,044]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006266	DNA ligation
GO:0006281	DNA repair
GO:0006302	double-strand break repair
GO:0006303	double-strand break repair via nonhomologous end joining
GO:0045087	innate immune response
GO:0045892	negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0050769	positive regulation of neurogenesis
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045893	positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0032481	positive regulation of type I interferon production
GO:0010212	response to ionizing radiation
GO:0000723	telomere maintenance
GO:0006351	transcription, DNA-dependent
GO:0033151	V(D)J recombination
GO:0016032	viral reproduction

Cellular Component

GO:0005829	cytosol
GO:0043564	Ku70:Ku80 complex
GO:0016020	membrane
GO:0070419	nonhomologous end joining complex
GO:0000783	nuclear telomere cap complex
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0005667	transcription factor complex

Molecular Function

GO:0051575	5'-deoxyribose-5-phosphate lyase activity
GO:0005524	ATP binding
GO:0004003	ATP-dependent DNA helicase activity
GO:0003684	damaged DNA binding
GO:0003677	DNA binding
GO:0044212	DNA regulatory region binding
GO:0003690	double-stranded DNA binding
GO:0003691	double-stranded telomeric DNA binding
GO:0005515	protein binding
GO:0008022	protein C-terminus binding

X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 6

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function