LSM4 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)

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同義遺伝子名

LSM4, GRP, YER112W, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, Glycine-rich protein

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:71.10 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:741.70 末梢神経:30.70 脊柱:- 網膜:- 目:129.30 動脈:- 静脈:- リンパ節:131.40 末梢血:36.40 脾臓:- 胸腺:25.80 骨髄:19.70 脂肪:- 骨:- 皮膚:14.40
GeneChip 大脳:7.10 小脳:7.15 脳幹:7.35 脳梁:6.43 松果体:- 末梢神経:7.18 脊柱:6.78 網膜:- 目:- 動脈:6.41 静脈:6.53 リンパ節:6.62 末梢血:- 脾臓:6.45 胸腺:8.10 骨髄:6.93 脂肪:6.75 骨:- 皮膚:6.96
CAGE 大脳:3.95 小脳:- 脳幹:3.76 脳梁:3.46 松果体:4.07 末梢神経:- 脊柱:3.50 網膜:- 目:- 動脈:3.76 静脈:3.92 リンパ節:4.03 末梢血:- 脾臓:3.69 胸腺:4.08 骨髄:- 脂肪:3.42 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.48 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:4.19 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.65 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:54.70 胎盤:127.50 前立腺:45.10 卵巣:- 精巣:90.90 心臓:229.90 骨格筋:20.10 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:17     肝臓:31.70        肺:176    膀胱:- 腎臓:62.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:101.60 膵臓:124.50 乳腺:46.50 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.97 胎盤:6.53 前立腺:7.19 卵巣:7.20 精巣:8.28 心臓:6.95 骨格筋:7.14 食道:7.39 胃:6.74 腸:7.27 結腸:7.68 肝臓:6.74 肺:6.77 膀胱:- 腎臓:7.43 下垂体:6.52 甲状腺:6.88 副腎:7.13 膵臓:7.16 乳腺:6.93 唾液腺:6.76
CAGE 子宮:3.47 胎盤:3.87 前立腺:3.59 卵巣:3.61 精巣:4.37 心臓:3.90 骨格筋:4.25 食道:3.77 胃:- 腸:3.92 結腸:4.17     肝臓:3.84    肺:3.87 膀胱:3.43 腎臓:3.92 下垂体:3.43 甲状腺:3.83 副腎:- 膵臓:3.99 乳腺:4.08 唾液腺:3.84
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:4.28 卵巣:4.07 精巣:4.89 心臓:3.53 骨格筋:3.99 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:3.79     肝臓:3.82        肺:4.16    膀胱:- 腎臓:4.25 下垂体:- 甲状腺:4.32 副腎:4.11 膵臓:- 乳腺:3.71 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_012321
Gene ID 25804
Unigene ID Hs.515255
Probe set ID 202736_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000130520
GTEx ID ENSG00000130520

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_015816
ラット[1]  NM_001106073

染色体

19p13.11  [18,417,720  -  18,434,001]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001163  Like-Sm ribonucleoprotein (LSM) domain
IPR006649  Like-Sm ribonucleoprotein (LSM) domain, eukaryotic/archaea-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10369684
10523320
10851237
10931946
11920408
11971955
12477932
12515382
12549820
15231747
15489334
15905169
16189514
17178857
17353931
17643375
19088440
19240061
19615732
20360068
21139048
21890473
21906983
21988832
22365833
22939629
24250222
24255165
24550385
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0043928  exonucleolytic nuclear-transcribed mRNA catabolic process involved in deadenylation-dependent decay
GO:0010467  gene expression
GO:0016071  mRNA metabolic process
GO:0006397  mRNA processing
GO:0000288  nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay
GO:0016070  RNA metabolic process
GO:0008380  RNA splicing

Cellular Component

GO:0005829  cytosol
GO:0030532  small nuclear ribonucleoprotein complex
GO:0005681  spliceosomal complex
GO:0005688  U6 snRNP

Molecular Function

GO:0005515  protein binding
GO:0003723  RNA binding