UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 3 (GalNAc-T3)

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同義遺伝子名

MGC61909, GalNAc-T3, DKFZp686C10199, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 3, Polypeptide GalNAc transferase 3, pp-GaNTase 3, HFTC, Protein-UDP acetylgalactosaminyltransferase 3, GALNT3, HHS

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:13 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:61.30 脊柱:- 網膜:- 目:29.40 動脈:- 静脈:- リンパ節:50.60 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:12.90 骨髄:19.70 脂肪:- 骨:- 皮膚:43.20
GeneChip 大脳:4.87 小脳:4.81 脳幹:4.82 脳梁:4.73 松果体:- 末梢神経:4.67 脊柱:4.91 網膜:- 目:- 動脈:4.95 静脈:4.85 リンパ節:4.76 末梢血:- 脾臓:4.84 胸腺:4.83 骨髄:5.15 脂肪:4.79 骨:- 皮膚:4.79
CAGE 大脳:1.14 小脳:- 脳幹:1.36 脳梁:1.88 松果体:0.83 末梢神経:- 脊柱:2.23 網膜:- 目:- 動脈:2.00 静脈:1.57 リンパ節:2.20 末梢血:- 脾臓:3.58 胸腺:0.96 骨髄:- 脂肪:1.12 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.04 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.23 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.38 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:145.80 胎盤:43.70 前立腺:78.90 卵巣:- 精巣:129.80 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:552.30 腸:64.80 結腸:186.60     肝臓:-        肺:122.20    膀胱:125.60 腎臓:31.20 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:35.60 乳腺:37.20 唾液腺:-
GeneChip 子宮:4.77 胎盤:4.91 前立腺:4.90 卵巣:4.87 精巣:4.79 心臓:4.88 骨格筋:4.88 食道:4.82 胃:4.92 腸:4.85 結腸:4.97 肝臓:4.87 肺:4.94 膀胱:- 腎臓:4.97 下垂体:4.88 甲状腺:4.80 副腎:5.02 膵臓:4.84 乳腺:4.91 唾液腺:4.89
CAGE 子宮:2.28 胎盤:2.34 前立腺:3.18 卵巣:2.42 精巣:3.60 心臓:0.36 骨格筋:0.13 食道:3.65 胃:- 腸:4.08 結腸:3.59     肝臓:0.55    肺:3.16 膀胱:2.99 腎臓:3.16 下垂体:3.53 甲状腺:4.01 副腎:- 膵臓:3.80 乳腺:3.06 唾液腺:3.77
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.65 卵巣:2.75 精巣:3.65 心臓:0.09 骨格筋:0.02 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:3.12     肝臓:0.41        肺:3.57    膀胱:- 腎臓:3.56 下垂体:- 甲状腺:3.69 副腎:0.87 膵臓:- 乳腺:1.86 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_004482
Gene ID 2591
Unigene ID Hs.170986
Probe set ID 203398_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000115339
GTEx ID ENSG00000115339

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_015736
ラット[1]  NM_001015032

染色体

2q24.3  [166,604,101  -  166,651,192]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8663203
9295285
9394011
9592121
9884405
12232759
12477932
12506059
12708471
14555840
14735190
15041730
15133511
15489334
15860931
16344560
16638743
16940445
17351710
17361208
17853462
18029348
18618993
18976705
19411468
19830424
20358599
21347749
21533022
21625220
22504420
23799843
24431446

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0005975  carbohydrate metabolic process
GO:0044267  cellular protein metabolic process
GO:0016266  O-glycan processing
GO:0043687  post-translational protein modification
GO:0018242  protein amino acid O-linked glycosylation via serine
GO:0018243  protein amino acid O-linked glycosylation via threonine

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005794  Golgi apparatus
GO:0032580  Golgi cisterna membrane
GO:0000139  Golgi membrane
GO:0016021  integral to membrane
GO:0016020  membrane
GO:0005634  nucleus
GO:0048471  perinuclear region of cytoplasm

Molecular Function

GO:0005509  calcium ion binding
GO:0030145  manganese ion binding
GO:0004653  polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase activity