UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast)

同義遺伝子名

Up-frameshift suppressor 2 homolog, Nonsense mRNA reducing factor 2, UPF2, RENT2, KIAA1408, Regulator of nonsense transcripts 2, hUpf2, HUPF2, MGC138835, DKFZP434D222, MGC138834

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:15.40

小脳:25.20

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:61.30

脊柱:112.30

網膜:-

目:58.80

動脈:30

静脈:-

リンパ節:91

末梢血:18.20

脾臓:56.70

胸腺:77.30

骨髄:137.80

脂肪:-

骨:51.20

皮膚:14.40

GeneChip

大脳:6.13

小脳:6.34

脳幹:6.03

脳梁:6.09

松果体:-

末梢神経:6.22

脊柱:5.92

網膜:-

目:-

動脈:6.24

静脈:6.03

リンパ節:6.64

末梢血:-

脾臓:6.47

胸腺:7.46

骨髄:6.40

脂肪:6.24

骨:-

皮膚:6.39

CAGE

大脳:2.27

小脳:-

脳幹:2.53

脳梁:2.11

松果体:3.06

末梢神経:-

脊柱:2.87

網膜:-

目:-

動脈:1.97

静脈:2.46

リンパ節:2.48

末梢血:-

脾臓:2.96

胸腺:3.14

骨髄:-

脂肪:2.73

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.20

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.32

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:3.34

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:45.60

胎盤:25.50

前立腺:22.50

卵巣:37.30

精巣:95.20

心臓:51.10

骨格筋:-

食道:-

胃:42.50

腸:-

結腸:127.20

肝臓:42.20

肺:73.30

膀胱:-

腎臓:20.80

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:253.90

膵臓:35.60

乳腺:92.90

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.66

胎盤:6.26

前立腺:6.89

卵巣:6.70

精巣:7.13

心臓:5.77

骨格筋:6.40

食道:6.14

胃:5.97

腸:5.71

結腸:5.15

肝臓:5.97

肺:6.30

膀胱:-

腎臓:5.37

下垂体:6.24

甲状腺:6.36

副腎:5.42

膵臓:5.56

乳腺:6.20

唾液腺:5.71

CAGE

子宮:2.92

胎盤:2.77

前立腺:3.24

卵巣:2.75

精巣:2.61

心臓:2.50

骨格筋:3.27

食道:2.86

胃:-

腸:2.93

結腸:2.51

肝臓:2.83

肺:2.56

膀胱:3.16

腎臓:2.64

下垂体:3.02

甲状腺:2.98

副腎:-

膵臓:2.08

乳腺:2.34

唾液腺:1.95

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:4.03

卵巣:3.58

精巣:4.28

心臓:3.03

骨格筋:3.80

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:4.02

肝臓:2.45

肺:2.69

膀胱:-

腎臓:3.08

下垂体:-

甲状腺:3.87

副腎:3.28

膵臓:-

乳腺:3.04

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_015542
Gene ID	26019
Unigene ID	Hs.370689
Probe set ID	203519_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000151461
GTEx ID	ENSG00000151461

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_001081132
ラット[1]	NM_001108421

染色体

10p14 [11,962,021 - 12,085,169]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0010467	gene expression
GO:0001889	liver development
GO:0006406	mRNA export from nucleus
GO:0016071	mRNA metabolic process
GO:0000184	nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
GO:0031100	organ regeneration
GO:0016070	RNA metabolic process

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005829	cytosol
GO:0035145	exon-exon junction complex
GO:0005634	nucleus
GO:0048471	perinuclear region of cytoplasm

Molecular Function

GO:0003677	DNA binding
GO:0005515	protein binding
GO:0003723	RNA binding

UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function