synovial sarcoma translocation gene on chromosome 18-like 1

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

SS18L1, SS18-like protein 1, MGC78386, LP2261, MGC26711, SYT homolog 1, KIAA0693, CREST

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:7.13 小脳:8.20 脳幹:7.03 脳梁:6.74 松果体:- 末梢神経:6.26 脊柱:6.81 網膜:- 目:- 動脈:6.21 静脈:5.75 リンパ節:6.43 末梢血:- 脾臓:6.73 胸腺:7.38 骨髄:5.95 脂肪:6.09 骨:- 皮膚:6.69
CAGE 大脳:3.48 小脳:- 脳幹:3.29 脳梁:3.10 松果体:3.17 末梢神経:- 脊柱:3.30 網膜:- 目:- 動脈:3.05 静脈:2.69 リンパ節:2.21 末梢血:- 脾臓:2.21 胸腺:2.52 骨髄:- 脂肪:2.62 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.03 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.52 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.40 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:6.68 胎盤:6.74 前立腺:7.03 卵巣:6.50 精巣:6.83 心臓:6 骨格筋:7.02 食道:6.34 胃:6.37 腸:6.40 結腸:5.55 肝臓:8.51 肺:6.59 膀胱:- 腎臓:6.99 下垂体:6.80 甲状腺:6.57 副腎:6.57 膵臓:5.31 乳腺:6.50 唾液腺:6.19
CAGE 子宮:2.81 胎盤:2.42 前立腺:2.84 卵巣:2.57 精巣:2.97 心臓:2.74 骨格筋:3.31 食道:2.55 胃:- 腸:2.49 結腸:2.91     肝臓:3.54    肺:2.80 膀胱:2.62 腎臓:2.72 下垂体:3.10 甲状腺:2.43 副腎:- 膵臓:2.98 乳腺:2.87 唾液腺:2.78
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.32 卵巣:2.44 精巣:2.46 心臓:1.53 骨格筋:1.45 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.47     肝臓:2.94        肺:1.86    膀胱:- 腎臓:2.66 下垂体:- 甲状腺:2.03 副腎:1.51 膵臓:- 乳腺:2.12 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_198935
Gene ID 26039
Unigene ID -
Probe set ID 213140_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000184402
GTEx ID ENSG00000184402

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_178750
ラット[1]  NM_138918

染色体

20q13.33  [60,718,822  -  60,757,540]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9734811
11435705
11780052
12477932
12696068
14716005
15489334
15866867
16189514
16484776
18331714
19081374
19615732
19724895
19851296
20198315
20211142
21145461
22371557
23708140
24360741
24457600

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0016568  chromatin modification
GO:0016358  dendrite development
GO:0045893  positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0050773  regulation of dendrite development
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0000777  condensed chromosome kinetochore
GO:0000780  condensed nuclear chromosome, centromeric region
GO:0016604  nuclear body
GO:0005634  nucleus