2-hydroxyacyl-CoA lyase 1

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同義遺伝子名

HACL1, 2-hydroxyphytanoyl-CoA lyase, 2-HPCL, HPCL2, HSPC279, HPCL, PHYH2, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:78.20 小脳:88.20 脳幹:- 脳梁:58.30 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:58.80 動脈:239.80 静脈:199.90 リンパ節:20.20 末梢血:72.90 脾臓:56.70 胸腺:38.70 骨髄:19.70 脂肪:40.30 骨:51.20 皮膚:38.40
GeneChip nodata
CAGE 大脳:3.14 小脳:- 脳幹:3.13 脳梁:3.43 松果体:3.37 末梢神経:- 脊柱:2.85 網膜:- 目:- 動脈:2.53 静脈:2.84 リンパ節:3.06 末梢血:- 脾臓:2.96 胸腺:3.41 骨髄:- 脂肪:3.29 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.30 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.97 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.27 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:100.20 胎盤:32.80 前立腺:45.10 卵巣:37.30 精巣:263.90 心臓:76.60 骨格筋:140.60 食道:- 胃:85 腸:194.40 結腸:17     肝臓:63.30        肺:48.90    膀胱:251.20 腎臓:83.20 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:101.60 膵臓:133.40 乳腺:92.90 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:3.32 胎盤:2.64 前立腺:2.79 卵巣:2.70 精巣:3.54 心臓:2.56 骨格筋:2.67 食道:2.69 胃:- 腸:4.18 結腸:3.24     肝臓:4.13    肺:2.69 膀胱:2.65 腎臓:3.32 下垂体:3.56 甲状腺:3.05 副腎:- 膵臓:3.13 乳腺:2.27 唾液腺:3.09
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.99 卵巣:2.94 精巣:4.04 心臓:2.34 骨格筋:3.49 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.94     肝臓:4.27        肺:2.50    膀胱:- 腎臓:3.28 下垂体:- 甲状腺:4.31 副腎:3.80 膵臓:- 乳腺:4.15 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_012260
Gene ID 26061
Unigene ID Hs.63290
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000131373
GTEx ID ENSG00000131373

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_019975
ラット [0]  

染色体

3p25.1  [15,602,211  -  15,643,338]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10468558
11042152
12477932
14561759
14702039
15489334
15644336
16189514
16344560
16756494
17370265
20178365
21708296
21890473
21900206
21906983
21963094
22002062
22939629
23000965

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0044255  cellular lipid metabolic process
GO:0001561  fatty acid alpha-oxidation
GO:0051259  protein oligomerization

Cellular Component

GO:0005782  peroxisomal matrix
GO:0005777  peroxisome

Molecular Function

GO:0016830  carbon-carbon lyase activity
GO:0048037  cofactor binding
GO:0042802  identical protein binding
GO:0000287  magnesium ion binding
GO:0005102  receptor binding
GO:0030976  thiamin pyrophosphate binding