protocadherin beta 5

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同義遺伝子名

PCDH-beta5, protocadherin beta 5, PCDHB5, Protocadherin beta 5 precursor, DKFZP586B0217, PCDH-BETA5

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:15.40 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:- 松果体:148.30 末梢神経:61.30 脊柱:112.30 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:25.80 骨髄:- 脂肪:- 骨:12.80 皮膚:-
GeneChip nodata
CAGE 大脳:2.33 小脳:- 脳幹:1.91 脳梁:2.46 松果体:2.91 末梢神経:- 脊柱:2.30 網膜:- 目:- 動脈:2.10 静脈:1.34 リンパ節:0.57 末梢血:- 脾臓:1.29 胸腺:0.18 骨髄:- 脂肪:1.66 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.89 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.41 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.14 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:22.50 卵巣:- 精巣:13 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:21.20 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:50.80 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:2.47 胎盤:0.88 前立腺:2.46 卵巣:2.86 精巣:1.72 心臓:1.70 骨格筋:1.23 食道:1.59 胃:- 腸:1.15 結腸:0.82     肝臓:1.21    肺:1.40 膀胱:2.02 腎臓:2.15 下垂体:2.68 甲状腺:1.79 副腎:- 膵臓:2.34 乳腺:1.36 唾液腺:1.82
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.87 卵巣:2.64 精巣:1.94 心臓:1.05 骨格筋:0.24 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.22     肝臓:0.16        肺:1.16    膀胱:- 腎臓:1.31 下垂体:- 甲状腺:2.16 副腎:1.10 膵臓:- 乳腺:0.63 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_015669
Gene ID 26167
Unigene ID Hs.119693
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000113209
GTEx ID ENSG00000113209

オーソログ対応遺伝子

マウス[8]  NM_053137, NM_053135, NM_053129, NM_053133, NM_053136, NM_053131
ラット [0]  

染色体

5q31.3  [140,514,800  -  140,517,703]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002126  Cadherin
IPR015919  Cadherin-like

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10380929
10716726
10817752
10835267
11230163
11322959
12231349
12477932
14702039
15489334
16344560
17353931
21139048
23000965

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0016339  calcium-dependent cell-cell adhesion
GO:0007156  homophilic cell adhesion
GO:0007416  synapse assembly
GO:0007268  synaptic transmission

Cellular Component

GO:0016021  integral to membrane
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0005509  calcium ion binding