spastic ataxia of Charlevoix-Saguenay (sacsin)

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同義遺伝子名

Sacsin, KIAA0730, ARSACS, spastic ataxia of Charlevoix-Saguenay (sacsin), DKFZp686B15167, SACS

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:67.60

小脳:25.20

脳幹:-

脳梁:116.60

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:29.40

動脈:60

静脈:66.60

リンパ節:60.70

末梢血:-

脾臓:18.90

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:80.70

骨:51.20

皮膚:9.60

GeneChip

大脳:6.96

小脳:5.62

脳幹:7.04

脳梁:6.23

松果体:-

末梢神経:7.22

脊柱:6.32

網膜:-

目:-

動脈:5.66

静脈:5.99

リンパ節:4.83

末梢血:-

脾臓:5.52

胸腺:6.09

骨髄:3.96

脂肪:4.16

骨:-

皮膚:4.38

CAGE

大脳:3.89

小脳:-

脳幹:4.16

脳梁:3.51

松果体:4.10

末梢神経:-

脊柱:3.87

網膜:-

目:-

動脈:3.60

静脈:3.03

リンパ節:2.70

末梢血:-

脾臓:2.81

胸腺:3.18

骨髄:-

脂肪:2.75

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:2.98

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:1.78

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:1.20

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:9.10

胎盤:7.30

前立腺:11.30

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:40.20

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:17

肝臓:21.10

肺:14.70

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:18.60

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.91

胎盤:3.63

前立腺:5.36

卵巣:5.15

精巣:5.18

心臓:5.06

骨格筋:7.14

食道:5.08

胃:4.46

腸:4.81

結腸:3.68

肝臓:3.54

肺:4.13

膀胱:-

腎臓:3.34

下垂体:4.92

甲状腺:4.01

副腎:4.44

膵臓:3.81

乳腺:5.06

唾液腺:4.87

CAGE

子宮:3.06

胎盤:1.41

前立腺:3.12

卵巣:2.74

精巣:2.58

心臓:3.24

骨格筋:3.13

食道:3.11

胃:-

腸:1.92

結腸:2.25

肝臓:1.29

肺:2.19

膀胱:3.46

腎臓:1.60

下垂体:3.16

甲状腺:1.81

副腎:-

膵臓:2.66

乳腺:2.53

唾液腺:2.95

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.16

卵巣:1.74

精巣:2.00

心臓:1.22

骨格筋:1.86

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.55

肝臓:0.38

肺:1.22

膀胱:-

腎臓:0.90

下垂体:-

甲状腺:1.91

副腎:1.57

膵臓:-

乳腺:1.42

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_014363
Gene ID	26278
Unigene ID	Hs.159492
Probe set ID	213262_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000151835
GTEx ID	ENSG00000151835

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_172809
ラット[2]	NM_172809

染色体

13q12.12 [23,902,965 - 24,007,841]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR019955

Ubiquitin supergroup

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0008219	cell death
GO:0090084	negative regulation of inclusion body assembly
GO:0006457	protein folding

Cellular Component

GO:0030424	axon
GO:0070852	cell body fiber
GO:0005737	cytoplasm
GO:0030425	dendrite
GO:0005739	mitochondrion
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0005524	ATP binding
GO:0051087	chaperone binding
GO:0030544	Hsp70 protein binding
GO:0070628	proteasome binding

spastic ataxia of Charlevoix-Saguenay (sacsin)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function