Berardinelli-Seip congenital lipodystrophy 2 (seipin)

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同義遺伝子名

SPG17, spastic paraplegia 17 (Silver syndrome), Seipin, MGC4694, BSCL2, GNG3LG

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

nodata

GeneChip

大脳:8.99

小脳:8.91

脳幹:9.07

脳梁:7.43

松果体:-

末梢神経:9.39

脊柱:8.26

網膜:-

目:-

動脈:6.88

静脈:6.09

リンパ節:6.79

末梢血:-

脾臓:6.42

胸腺:6.96

骨髄:6.23

脂肪:6.88

骨:-

皮膚:6.87

CAGE

大脳:5.29

小脳:-

脳幹:4.85

脳梁:4.64

松果体:5.21

末梢神経:-

脊柱:4.77

網膜:-

目:-

動脈:4.11

静脈:3.95

リンパ節:3.95

末梢血:-

脾臓:3.81

胸腺:4.22

骨髄:-

脂肪:3.92

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:5.54

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.20

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.12

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

nodata

GeneChip

子宮:7.14

胎盤:6.21

前立腺:7.70

卵巣:7.46

精巣:9.88

心臓:6.13

骨格筋:6.18

食道:7.20

胃:7.05

腸:6.99

結腸:7.20

肝臓:6.71

肺:7.24

膀胱:-

腎臓:7.69

下垂体:9.59

甲状腺:7.51

副腎:7.13

膵臓:7.05

乳腺:7.44

唾液腺:8.21

CAGE

子宮:4.25

胎盤:3.94

前立腺:4.29

卵巣:4.19

精巣:5.78

心臓:3.50

骨格筋:3.30

食道:3.87

胃:-

腸:3.74

結腸:4.00

肝臓:4.31

肺:4.34

膀胱:3.65

腎臓:4.53

下垂体:5.38

甲状腺:4.63

副腎:-

膵臓:4.33

乳腺:4.54

唾液腺:5.05

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.38

卵巣:0.69

精巣:1.75

心臓:0

骨格筋:0

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.24

肝臓:0.13

肺:0.09

膀胱:-

腎臓:0.51

下垂体:-

甲状腺:0.14

副腎:0.05

膵臓:-

乳腺:0.08

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001122955
Gene ID	26580
Unigene ID	-
Probe set ID	208906_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000168000
GTEx ID	ENSG00000168000

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]	NM_001136064, NM_008144
ラット[4]	NM_001136064, NM_008144

染色体

11q12.3 [62,457,747 - 62,477,317]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0008150	biological_process
GO:0008219	cell death
GO:0045444	fat cell differentiation
GO:0016042	lipid catabolic process
GO:0034389	lipid particle organization
GO:0019915	lipid storage
GO:0050995	negative regulation of lipid catabolic process

Cellular Component

GO:0030176

integral to endoplasmic reticulum membrane

Molecular Function

GO:0003674

molecular_function

Berardinelli-Seip congenital lipodystrophy 2 (seipin)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function