cold shock domain containing C2, RNA binding

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同義遺伝子名

cold shock domain containing C2, RNA binding, RNA-binding protein PIPPin, CSDC2, dJ347H13.2, PIPPin, PIPPIN, Cold shock domain-containing protein C2

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:62.80

小脳:25.20

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:88.20

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:12.80

皮膚:-

GeneChip

大脳:6.66

小脳:7.58

脳幹:7.24

脳梁:6.08

松果体:-

末梢神経:6.12

脊柱:6.64

網膜:-

目:-

動脈:7.55

静脈:6.87

リンパ節:5.96

末梢血:-

脾臓:5.70

胸腺:5.68

骨髄:6.07

脂肪:5.82

骨:-

皮膚:5.87

CAGE

大脳:3.32

小脳:-

脳幹:3.22

脳梁:2.28

松果体:4.16

末梢神経:-

脊柱:3.60

網膜:-

目:-

動脈:3.63

静脈:1.57

リンパ節:0.06

末梢血:-

脾臓:0.25

胸腺:0.06

骨髄:-

脂肪:1.07

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:1.51

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:1.41

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.77

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:27.30

胎盤:-

前立腺:33.80

卵巣:37.30

精巣:8.70

心臓:12.80

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:4.90

膀胱:-

腎臓:72.80

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:50.80

膵臓:8.90

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.66

胎盤:5.68

前立腺:5.64

卵巣:6.64

精巣:7.22

心臓:7.71

骨格筋:5.93

食道:5.90

胃:5.63

腸:6.15

結腸:5.86

肝臓:5.83

肺:5.93

膀胱:-

腎臓:7.16

下垂体:6.84

甲状腺:5.89

副腎:8.35

膵臓:7.13

乳腺:5.47

唾液腺:5.94

CAGE

子宮:3.94

胎盤:0.95

前立腺:2.44

卵巣:4.30

精巣:3.35

心臓:4.80

骨格筋:1.34

食道:1.31

胃:-

腸:0.33

結腸:1.10

肝臓:0.46

肺:1.89

膀胱:2.89

腎臓:3.38

下垂体:2.96

甲状腺:0.60

副腎:-

膵臓:3.45

乳腺:1.16

唾液腺:0.36

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.50

卵巣:5.28

精巣:3.12

心臓:4.69

骨格筋:0.52

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.18

肝臓:0.18

肺:2.59

膀胱:-

腎臓:3.46

下垂体:-

甲状腺:0.74

副腎:1.06

膵臓:-

乳腺:0.43

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_014460
Gene ID	27254
Unigene ID	Hs.310893
Probe set ID	209981_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000172346
GTEx ID	ENSG00000172346

オーソログ対応遺伝子

マウス[3]	NM_145473
ラット [0]

染色体

22q13.2 [41,956,767 - 42,069,998]

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遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Cold shock protein

Link to Pubmed (Pubmed ID)

8573167
8619474
9110174
10446180
10591208
10923677
12477932
12767259
12801884
15461802
15489334
16344560
17474147
18029348

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006398	histone mRNA 3'-end processing
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0003677	DNA binding
GO:0003723	RNA binding