LSM1 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)

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同義遺伝子名

LSM1, CASM, Small nuclear ribonuclear CaSm, Cancer-associated Sm-like, YJL124C, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:23.70 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:- 松果体:148.30 末梢神経:61.30 脊柱:- 網膜:- 目:41.10 動脈:60 静脈:- リンパ節:60.70 末梢血:- 脾臓:37.80 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:14.40
GeneChip 大脳:7.95 小脳:7.87 脳幹:8.12 脳梁:7.75 松果体:- 末梢神経:7.69 脊柱:7.90 網膜:- 目:- 動脈:8.26 静脈:8.51 リンパ節:8.13 末梢血:- 脾臓:8 胸腺:8.28 骨髄:7.92 脂肪:8.29 骨:- 皮膚:8.24
CAGE 大脳:3.33 小脳:- 脳幹:3.25 脳梁:3.06 松果体:3.48 末梢神経:- 脊柱:3.26 網膜:- 目:- 動脈:3.68 静脈:3.23 リンパ節:3.31 末梢血:- 脾臓:3.28 胸腺:3.06 骨髄:- 脂肪:3.05 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.11 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.49 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.75 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:9.10 胎盤:54.60 前立腺:67.60 卵巣:- 精巣:21.60 心臓:12.80 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:68.40    膀胱:- 腎臓:114.40 下垂体:- 甲状腺:163.70 副腎:- 膵臓:97.80 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:8.38 胎盤:8.40 前立腺:8.35 卵巣:8.38 精巣:8.27 心臓:8.56 骨格筋:8.19 食道:8.20 胃:8.21 腸:8.19 結腸:8.08 肝臓:8.04 肺:7.99 膀胱:- 腎臓:8.50 下垂体:8.07 甲状腺:8.13 副腎:8.40 膵臓:8.14 乳腺:8.15 唾液腺:8.48
CAGE 子宮:3.28 胎盤:3.60 前立腺:3.27 卵巣:3.20 精巣:3.23 心臓:3.84 骨格筋:3.38 食道:3.49 胃:- 腸:3.51 結腸:3.41     肝臓:3.51    肺:3.10 膀胱:3.43 腎臓:3.78 下垂体:3.57 甲状腺:3.43 副腎:- 膵臓:3.50 乳腺:3.90 唾液腺:3.56
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.55 卵巣:3.10 精巣:3.71 心臓:3.49 骨格筋:2.22 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:3.11     肝臓:2.28        肺:2.64    膀胱:- 腎臓:1.85 下垂体:- 甲状腺:2.98 副腎:3.37 膵臓:- 乳腺:3.20 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_014462
Gene ID 27257
Unigene ID Hs.425311
Probe set ID 203534_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000175324
GTEx ID ENSG00000175324

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_026032
ラット[1]  NM_001108876

染色体

8p11.23  [38,020,839  -  38,034,248]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001163  Like-Sm ribonucleoprotein (LSM) domain
IPR006649  Like-Sm ribonucleoprotein (LSM) domain, eukaryotic/archaea-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8980254
9230209
10369684
10523320
10851237
11920408
11953827
12477932
12515382
14667819
15231747
15342556
15489334
16147992
16699599
16756390
17001308
17178857
18172165
18218995
18559850
20379614
21139048
21788678
22037555
22863883
22939629
24035562
24250222

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0043928  exonucleolytic nuclear-transcribed mRNA catabolic process involved in deadenylation-dependent decay
GO:0010467  gene expression
GO:0071044  histone mRNA catabolic process
GO:0016071  mRNA metabolic process
GO:0006397  mRNA processing
GO:0000288  nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay
GO:0016070  RNA metabolic process
GO:0008380  RNA splicing
GO:0000375  RNA splicing, via transesterification reactions

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005829  cytosol
GO:0005634  nucleus
GO:0030529  ribonucleoprotein complex

Molecular Function

GO:0005515  protein binding
GO:0003723  RNA binding