LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)

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同義遺伝子名

YLR438C, MDS017, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, LSM3, SMX4, USS2

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:7.68 小脳:7.60 脳幹:7.71 脳梁:7.76 松果体:- 末梢神経:7.70 脊柱:7.91 網膜:- 目:- 動脈:7.88 静脈:8.10 リンパ節:8.07 末梢血:- 脾臓:7.85 胸腺:8.93 骨髄:8.08 脂肪:8.21 骨:- 皮膚:8.20
CAGE 大脳:2.99 小脳:- 脳幹:3.03 脳梁:2.86 松果体:2.72 末梢神経:- 脊柱:3.21 網膜:- 目:- 動脈:2.55 静脈:2.74 リンパ節:2.83 末梢血:- 脾臓:3.11 胸腺:3.32 骨髄:- 脂肪:2.65 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:5.80 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:5.52 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:5.37 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:8.31 胎盤:8.62 前立腺:8.50 卵巣:8.39 精巣:8.98 心臓:8.31 骨格筋:8.30 食道:8.17 胃:7.90 腸:8.21 結腸:7.94 肝臓:7.67 肺:7.95 膀胱:- 腎臓:8.42 下垂体:7.81 甲状腺:8.50 副腎:7.78 膵臓:7.93 乳腺:8.03 唾液腺:8.07
CAGE 子宮:2.80 胎盤:3.05 前立腺:3.06 卵巣:2.72 精巣:3.52 心臓:2.83 骨格筋:3.48 食道:3.26 胃:- 腸:3.16 結腸:2.70     肝臓:3.39    肺:2.83 膀胱:2.92 腎臓:3.58 下垂体:2.70 甲状腺:3.23 副腎:- 膵臓:2.98 乳腺:2.69 唾液腺:3.01
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:6.07 卵巣:5.76 精巣:7.03 心臓:5.50 骨格筋:5.15 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:6.08     肝臓:5.35        肺:5.45    膀胱:- 腎臓:6.04 下垂体:- 甲状腺:6.27 副腎:6.13 膵臓:- 乳腺:6.02 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_014463
Gene ID 27258
Unigene ID -
Probe set ID 202209_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000170860
GTEx ID ENSG00000170860

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_026309
ラット[1]  NM_001106611

染色体

3p25.1  [14,219,858  -  14,242,619]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001163  Like-Sm ribonucleoprotein (LSM) domain
IPR006649  Like-Sm ribonucleoprotein (LSM) domain, eukaryotic/archaea-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10369684
10523320
10851237
11920408
11991638
12477932
12515382
14667819
15231747
15489334
16169070
16344560
17643375
18187620
19060904
21139048
21988832
22365833
22623428
22939629
23463506
23667531

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0043928  exonucleolytic nuclear-transcribed mRNA catabolic process involved in deadenylation-dependent decay
GO:0010467  gene expression
GO:0016071  mRNA metabolic process
GO:0006397  mRNA processing
GO:0000398  nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0000288  nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay
GO:0016070  RNA metabolic process

Cellular Component

GO:0071013  catalytic step 2 spliceosome
GO:0005829  cytosol
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0005515  protein binding
GO:0003723  RNA binding