PRP19/PSO4 pre-mRNA processing factor 19 homolog (S. cerevisiae)

同義遺伝子名

hPso4, NMP200, Nuclear matrix protein 200, Pre-mRNA-splicing factor 19, hPSO4, PRP19, UBOX4, PRPF19, PRP19/PSO4 homolog, PRP19/PSO4 homolog (S. cerevisiae), PSO4

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:14.20

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:30.70

脊柱:112.30

網膜:-

目:76.40

動脈:30

静脈:-

リンパ節:40.40

末梢血:36.40

脾臓:-

胸腺:12.90

骨髄:19.70

脂肪:-

骨:-

皮膚:19.20

GeneChip

大脳:8.24

小脳:8.33

脳幹:8.33

脳梁:7.63

松果体:-

末梢神経:7.73

脊柱:7.80

網膜:-

目:-

動脈:7.73

静脈:7.40

リンパ節:7.93

末梢血:-

脾臓:8.09

胸腺:8.08

骨髄:7.71

脂肪:7.50

骨:-

皮膚:7.94

CAGE

大脳:4.67

小脳:-

脳幹:4.52

脳梁:4.13

松果体:4.29

末梢神経:-

脊柱:4.23

網膜:-

目:-

動脈:3.96

静脈:4.22

リンパ節:4.38

末梢血:-

脾臓:4.36

胸腺:4.69

骨髄:-

脂肪:3.87

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:5.51

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:4.43

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:4.47

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:27.30

胎盤:40.10

前立腺:11.30

卵巣:37.30

精巣:21.60

心臓:51.10

骨格筋:-

食道:-

胃:191.20

腸:-

結腸:101.80

肝臓:-

肺:68.40

膀胱:-

腎臓:31.20

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:8.90

乳腺:18.60

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.87

胎盤:7.05

前立腺:8.29

卵巣:8.11

精巣:7.56

心臓:7.25

骨格筋:6.95

食道:8.16

胃:7.76

腸:7.56

結腸:7.96

肝臓:7.76

肺:7.45

膀胱:-

腎臓:7.54

下垂体:8.41

甲状腺:7.72

副腎:8.08

膵臓:7.21

乳腺:8.08

唾液腺:7.65

CAGE

子宮:4.11

胎盤:4.04

前立腺:4.29

卵巣:4.49

精巣:4.03

心臓:3.87

骨格筋:4.22

食道:4.42

胃:-

腸:4.00

結腸:4.21

肝臓:4.56

肺:3.85

膀胱:4.27

腎臓:4.08

下垂体:4.49

甲状腺:4.12

副腎:-

膵臓:4.18

乳腺:4.40

唾液腺:4.08

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:4.93

卵巣:5.72

精巣:5.33

心臓:3.14

骨格筋:4.63

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:4.56

肝臓:4.48

肺:3.93

膀胱:-

腎臓:4.56

下垂体:-

甲状腺:5.52

副腎:5.72

膵臓:-

乳腺:4.73

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_014502
Gene ID	27339
Unigene ID	Hs.502705
Probe set ID	203103_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000110107
GTEx ID	ENSG00000110107

オーソログ対応遺伝子

マウス[3]	NM_134129
ラット[1]	NM_139333

染色体

11q12.2 [60,658,202 - 60,674,060]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR020472	G-protein beta WD-40 repeat, region
IPR003613	U box domain
IPR001680	WD40 repeat
IPR019782	WD40 repeat 2
IPR019781	WD40 repeat, subgroup
IPR011046	WD40 repeat-like-containing domain
IPR017986	WD40-repeat-containing domain
IPR015943	WD40/YVTN repeat-like-containing domain
IPR013083	Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006281	DNA repair
GO:0001833	inner cell mass cell proliferation
GO:0008610	lipid biosynthetic process
GO:0045665	negative regulation of neuron differentiation
GO:0000398	nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0048711	positive regulation of astrocyte differentiation
GO:0048026	positive regulation of nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0000209	protein polyubiquitination
GO:0000245	spliceosome assembly

Cellular Component

GO:0071013	catalytic step 2 spliceosome
GO:0005737	cytoplasm
GO:0005811	lipid particle
GO:0016607	nuclear speck
GO:0005634	nucleus
GO:0000974	Prp19 complex
GO:0005819	spindle
GO:0000151	ubiquitin ligase complex

Molecular Function

GO:0003677	DNA binding
GO:0042802	identical protein binding
GO:0005515	protein binding
GO:0004842	ubiquitin-protein ligase activity
GO:0034450	ubiquitin-ubiquitin ligase activity

PRP19/PSO4 pre-mRNA processing factor 19 homolog (S. cerevisiae)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function