amylase, alpha 1C (salivary)

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同義遺伝子名

amylase, alpha 1C; salivary, AMY1C

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:4.90 小脳:5.15 脳幹:4.79 脳梁:5.16 松果体:- 末梢神経:4.14 脊柱:4.37 網膜:- 目:- 動脈:4.31 静脈:4.11 リンパ節:5.65 末梢血:- 脾臓:5.40 胸腺:5.93 骨髄:3.78 脂肪:4.54 骨:- 皮膚:5.16
CAGE nodata
RNA-seq 大脳:0.00 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.00 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.00 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:4.84 胎盤:3.24 前立腺:4.92 卵巣:6.80 精巣:4.50 心臓:4.49 骨格筋:5.77 食道:4.29 胃:4 腸:8.77 結腸:3.54 肝臓:5.40 肺:4.99 膀胱:- 腎臓:5.11 下垂体:4.51 甲状腺:7.67 副腎:4.78 膵臓:13.37 乳腺:4.84 唾液腺:12.90
CAGE nodata
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.00 卵巣:0.21 精巣:0.00 心臓:0.00 骨格筋:0.00 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.00     肝臓:0.00        肺:0.00    膀胱:- 腎臓:0.00 下垂体:- 甲状腺:0.00 副腎:0.00 膵臓:- 乳腺:0.00 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001008219
Gene ID 278
Unigene ID -
Probe set ID 208498_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000174876
ENSG00000187733
GTEx ID ENSG00000174876
ENSG00000187733

オーソログ対応遺伝子

マウス[6]  NM_001110505, NM_007446, NM_001042711, NM_001160150, NM_001160151, NM_001160152
ラット[1]  NM_001010970, NM_031502, NM_001042711, NM_001160150, NM_001160151, NM_001160152

染色体

1p21.1  [104,197,912  -  104,262,518]
1p21.1  [104,219,358  -  104,239,302]
1p21.1  [104,293,028  -  104,301,312]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR006048  Alpha-amylase, C-terminal all beta
IPR006046  Glycoside hydrolase family 13
IPR017853  Glycoside hydrolase, catalytic core
IPR013781  Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core
IPR013780  Glycosyl hydrolase, family 13, all-beta
IPR006047  Glycosyl hydrolase, family 13, catalytic domain
IPR006589  Glycosyl hydrolase, family 13, subfamily, catalytic domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

2081604
2423416
2452973
2788608
6176528
6608795
12414807
12477932
15286789
16203048
16502470
17353931
19199708

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0005975  carbohydrate metabolic process
GO:0007586  digestion

Cellular Component

GO:0005576  extracellular region

Molecular Function

GO:0004556  alpha-amylase activity
GO:0046872  metal ion binding
GO:0005515  protein binding