RNA binding motif protein 15B

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同義遺伝子名

RNA-binding motif protein 15B, RBM15B, Putative RNA-binding protein 15B, OTT3, HUMAGCGB, RNA binding motif protein 15B

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:11.90 小脳:- 脳幹:- 脳梁:29.20 松果体:- 末梢神経:61.30 脊柱:- 網膜:118.60 目:11.80 動脈:- 静脈:- リンパ節:40.40 末梢血:36.40 脾臓:18.90 胸腺:12.90 骨髄:19.70 脂肪:- 骨:12.80 皮膚:43.20
GeneChip 大脳:7.01 小脳:7.10 脳幹:6.86 脳梁:6.79 松果体:- 末梢神経:7 脊柱:6.80 網膜:- 目:- 動脈:7.14 静脈:7.14 リンパ節:7.02 末梢血:- 脾臓:7.07 胸腺:7.17 骨髄:6.96 脂肪:7.33 骨:- 皮膚:7.15
CAGE 大脳:2.78 小脳:- 脳幹:2.54 脳梁:2.87 松果体:2.63 末梢神経:- 脊柱:2.38 網膜:- 目:- 動脈:3.28 静脈:3.06 リンパ節:3.16 末梢血:- 脾臓:2.99 胸腺:3.82 骨髄:- 脂肪:3.12 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.43 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.93 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.58 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:54.70 胎盤:18.20 前立腺:11.30 卵巣:- 精巣:121.10 心臓:76.60 骨格筋:- 食道:- 胃:21.20 腸:- 結腸:101.80     肝臓:10.60        肺:24.40    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:83.60 唾液腺:328.40
GeneChip 子宮:7.31 胎盤:7.09 前立腺:7.17 卵巣:7.23 精巣:7.64 心臓:7.05 骨格筋:6.65 食道:7.15 胃:7.28 腸:7.17 結腸:7.52 肝臓:7.02 肺:7.05 膀胱:- 腎臓:7.07 下垂体:7.08 甲状腺:7.29 副腎:7.10 膵臓:7.44 乳腺:7.49 唾液腺:7.56
CAGE 子宮:2.81 胎盤:2.89 前立腺:3.10 卵巣:3.16 精巣:3.26 心臓:2.75 骨格筋:2.44 食道:3.03 胃:- 腸:3.14 結腸:3.28     肝臓:3.03    肺:2.94 膀胱:2.87 腎臓:2.60 下垂体:2.61 甲状腺:3.00 副腎:- 膵臓:3.13 乳腺:3.02 唾液腺:2.35
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.96 卵巣:3.39 精巣:3.19 心臓:2.01 骨格筋:1.95 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.99     肝臓:2.25        肺:2.39    膀胱:- 腎臓:2.51 下垂体:- 甲状腺:3.29 副腎:3.55 膵臓:- 乳腺:3.31 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_013286
Gene ID 29890
Unigene ID Hs.118738
Probe set ID 202689_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000179837
GTEx ID ENSG00000179837

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_175402
ラット[1]  NM_175402

染色体

3p21.2  [51,428,731  -  51,435,330]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000504  RNA recognition motif, RNP-1
IPR012921  Spen paralogue and orthologue SPOC, C-terminal
IPR010912  Spen paralogue/orthologue C-terminal, metazoa

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8401585
8889548
12477932
15302935
15489334
16009940
16129689
17081983
18029348
19336002
19586903
19596686
20811636
21106733
21988832
22939629
24163370
24457600
24515614
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006397  mRNA processing
GO:0045892  negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006913  nucleocytoplasmic transport
GO:0000381  regulation of alternative nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0008380  RNA splicing
GO:0006351  transcription, DNA-dependent
GO:0019048  virus-host interaction

Cellular Component

GO:0005730  nucleolus
GO:0005654  nucleoplasm
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0000166  nucleotide binding
GO:0005515  protein binding
GO:0003723  RNA binding