H2A histone family, member X

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同義遺伝子名

Histone H2A.x, H2AFX, H2A histone family, member X, H2A/X, H2A.X, H2a/x, H2AX

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:24.90

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:117.50

動脈:30

静脈:66.60

リンパ節:717.80

末梢血:18.20

脾臓:18.90

胸腺:-

骨髄:19.70

脂肪:-

骨:12.80

皮膚:24

GeneChip

大脳:6.05

小脳:6.08

脳幹:6.01

脳梁:6.32

松果体:-

末梢神経:5.66

脊柱:5.87

網膜:-

目:-

動脈:5.63

静脈:5.65

リンパ節:5.91

末梢血:-

脾臓:5.33

胸腺:6.15

骨髄:6.33

脂肪:5.58

骨:-

皮膚:5.61

CAGE

大脳:4.21

小脳:-

脳幹:4.51

脳梁:4.79

松果体:3.79

末梢神経:-

脊柱:4.31

網膜:-

目:-

動脈:3.37

静脈:4.53

リンパ節:4.54

末梢血:-

脾臓:4.45

胸腺:6.71

骨髄:-

脂肪:3.62

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.08

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.61

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.41

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:27.30

胎盤:36.40

前立腺:33.80

卵巣:74.50

精巣:17.30

心臓:204.30

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:42.40

肝臓:10.60

肺:68.40

膀胱:-

腎臓:41.60

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:53.30

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.64

胎盤:5.49

前立腺:5.40

卵巣:5.83

精巣:5.85

心臓:5.70

骨格筋:5.84

食道:5.90

胃:5.70

腸:5.59

結腸:5.96

肝臓:5.65

肺:5.69

膀胱:-

腎臓:5.56

下垂体:6

甲状腺:5.46

副腎:5.75

膵臓:5.34

乳腺:5.53

唾液腺:5.74

CAGE

子宮:3.62

胎盤:4.52

前立腺:3.69

卵巣:4.20

精巣:5.41

心臓:3.31

骨格筋:3.49

食道:4.34

胃:-

腸:3.99

結腸:4.47

肝臓:3.13

肺:3.94

膀胱:3.52

腎臓:3.53

下垂体:3.64

甲状腺:3.85

副腎:-

膵臓:3.73

乳腺:3.80

唾液腺:3.13

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.28

卵巣:3.51

精巣:3.34

心臓:1.35

骨格筋:1.97

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.80

肝臓:1.39

肺:3.06

膀胱:-

腎臓:2.67

下垂体:-

甲状腺:2.80

副腎:2.87

膵臓:-

乳腺:2.32

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_002105
Gene ID	3014
Unigene ID	Hs.477879
Probe set ID	212525_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000188486
GTEx ID	ENSG00000188486

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_010436
ラット[1]	NM_001109291

染色体

11q23.3 [118,964,564 - 118,966,177]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0000077	DNA damage checkpoint
GO:0006281	DNA repair
GO:0006302	double-strand break repair
GO:0000724	double-strand break repair via homologous recombination
GO:0007126	meiosis
GO:0006334	nucleosome assembly
GO:0045739	positive regulation of DNA repair
GO:0006974	response to DNA damage stimulus
GO:0010212	response to ionizing radiation
GO:0007283	spermatogenesis

Cellular Component

GO:0000781	chromosome, telomeric region
GO:0000794	condensed nuclear chromosome
GO:0001673	male germ cell nucleus
GO:0000790	nuclear chromatin
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0000786	nucleosome
GO:0005634	nucleus
GO:0005657	replication fork
GO:0001741	XY body

Molecular Function

GO:0003684	damaged DNA binding
GO:0003677	DNA binding
GO:0019899	enzyme binding
GO:0042393	histone binding
GO:0005515	protein binding
GO:0046982	protein heterodimerization activity

H2A histone family, member X

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function