histone deacetylase 1

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

histone deacetylase 1, HDAC1, Histone deacetylase 1, HD1, RPD3L1, GON-10, DKFZp686H12203

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:30.80 小脳:- 脳幹:- 脳梁:175 松果体:- 末梢神経:92 脊柱:- 網膜:118.60 目:117.50 動脈:89.90 静脈:- リンパ節:283.10 末梢血:164 脾臓:37.80 胸腺:38.70 骨髄:19.70 脂肪:80.70 骨:51.20 皮膚:672
GeneChip 大脳:6.24 小脳:4.64 脳幹:6.21 脳梁:7.14 松果体:- 末梢神経:6.98 脊柱:6.90 網膜:- 目:- 動脈:7.45 静脈:6.80 リンパ節:8.64 末梢血:- 脾臓:8.61 胸腺:9.14 骨髄:7.94 脂肪:7.25 骨:- 皮膚:7.47
CAGE 大脳:2.67 小脳:- 脳幹:2.86 脳梁:3.21 松果体:3.70 末梢神経:- 脊柱:3.26 網膜:- 目:- 動脈:3.37 静脈:3.79 リンパ節:4.01 末梢血:- 脾臓:3.74 胸腺:4.30 骨髄:- 脂肪:2.91 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.08 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:5.81 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:4.37 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:36.50 胎盤:72.90 前立腺:78.90 卵巣:223.60 精巣:64.90 心臓:63.90 骨格筋:- 食道:- 胃:4269.70 腸:64.80 結腸:390.10     肝臓:73.90        肺:107.50    膀胱:251.20 腎臓:52 下垂体:232 甲状腺:327.50 副腎:- 膵臓:71.10 乳腺:957.20 唾液腺:-
GeneChip 子宮:8.09 胎盤:7.69 前立腺:8.45 卵巣:8.37 精巣:7.86 心臓:7.06 骨格筋:6.15 食道:8.56 胃:8.25 腸:7.88 結腸:8.65 肝臓:7.41 肺:7.88 膀胱:- 腎臓:7.76 下垂体:7.69 甲状腺:8.67 副腎:7.82 膵臓:7.32 乳腺:7.94 唾液腺:7.92
CAGE 子宮:3.61 胎盤:3.51 前立腺:3.67 卵巣:3.57 精巣:3.50 心臓:3.09 骨格筋:2.11 食道:3.60 胃:- 腸:3.85 結腸:3.96     肝臓:3.32    肺:3.28 膀胱:3.05 腎臓:3.40 下垂体:3.52 甲状腺:3.93 副腎:- 膵臓:3.16 乳腺:3.49 唾液腺:3.84
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:5.73 卵巣:5.84 精巣:5.37 心臓:3.56 骨格筋:2.51 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:5.16     肝臓:4.31        肺:4.86    膀胱:- 腎臓:5.23 下垂体:- 甲状腺:5.64 副腎:5.59 膵臓:- 乳腺:4.09 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_004964
Gene ID 3065
Unigene ID Hs.88556
Probe set ID 201209_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000116478
GTEx ID ENSG00000116478

オーソログ対応遺伝子

マウス [0]  
ラット [0]  

染色体

1p35.1  [32,757,687  -  32,799,236]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003084  Histone deacetylase
IPR000286  Histone deacetylase superfamily

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7760804
8125298
8289393
8602525
8602529
8646880
9150133
9150134
9150135
9346952
9371597
9468139
9468140
9486654
9491888
9520398
9611234
9627120
9650586
9651585
9694793
9722949
9724731
9753732
9765306
9790534
9804427
9819405
9858615
9885572
9988677
10049357
10199400
10204490
10220385
10220405
10228159
10357820
10403782
10409740
10444591
10471499
10471500
10487760
10490602
10491605
10499802
10521394
10531300
10545197
10575014
10581039
10611298
10615135
10640275
10655483
10669754
10688671
10704340
10734134
10737769
10777477
10778858
10779361
10840944
10846170
10873456
10888618
10888886
10898795
10904264
10933397
10944117
10958676
10958684
10969803
10983972
10995736
11006275
11013263
11022042
11046157
11062478
11099047
11101889
11102443
11118440
11136718
11146623
11158299
11171972
11226163
11238380
11238932
11259576
11266540
11279209
11283259
11283269
11285237
11287616
11287668
11297506
11302704
11306568
11313951
11319226
11327722
11331609
11350943
11390640
11427533
11430826
11438660
11447271
11466315
11470869
11486045
11517158
11532945
11533236
11552981
11553631
11564889
11568182
11583987
11585818
11593411
11602581
11641274
11641275
11684023
11739383
11749695
11756549
11777905
11784859
11788710
11804585
11836251
11839806
11850410
11855854
11863372
11865059
11867749
11884454
11896613
11909966
11919195
11929879
11931768
11931769
11940654
11959842
11960997
11994312
12015309
12015313
12032081
12032298
12045192
12052894
12082111
12082639
12087472
12091390
12124384
12150997
12176973
12177302
12183469
12192000
12198164
12198165
12200149
12202768
12242305
12242670
12354758
12370815
12371150
12374985
12393750
12393887
12398767
12419806
12426395
12435627
12450794
12453419
12464179
12466959
12473678
12477932
12482978
12493763
12529400
12535528
12567184
12574125
12579268
12586827
12590135
12612053
12634383
12659862
12665568
12665570
12670868
12697811
12700765
12705869
12711221
12711603
12724404
12730668
12788099
12789259
12808109
12821938
12829790
12847090
12890497
12904571
12920132
12943729
12947414
12972430
13679859
14506250
14506733
14530259
14559791
14578449
14593184
14612411
14633989
14637159
14645126
14645718
14647463
14668799
14670976
14673164
14678988
14691252
14699069
14722073
14752048
14968110
14976551
14981544
14988403
15003538
15016876
15042618
15044952
15051733
15060175
15077161
15120635
15136563
15138260
15140878
15148359
15155736
15173318
15192014
15194748
15199155
15207703
15235594
15273251
15297431
15298701
15316101
15325272
15333839
15361834
15388328
15451426
15454082
15454570
15456747
15467736
15469820
15485920
15489334
15509593
15520282
15528196
15536134
15542849
15557281
15561714
15590418
15592455
15615716
15619633
15635413
15640443
15653507
15668237
15674334
15688037
15695521
15701600
15710329
15711539
15713621
15713622
15713663
15722551
15735762
15775975
15826950
15829968
15831498
15831516
15835920
15870198
15897453
15899845
15919722
15927959
15935060
15970276
15987735
16024608
16079794
16082198
16085498
16091750
16107708
16107876
16121030
16140033
16147992
16166625
16169070
16172792
16186112
16195230
16196087
16197452
16204234
16204248
16217013
16287849
16288017
16288053
16306601
16319923
16331260
16337145
16374504
16377629
16387653
16407282
16407974
16428440
16464847
16478997
16481466
16481475
16483679
16511565
16528103
16540471
16565076
16569215
16611996
16630892
16645043
16649994
16651408
16652147
16697957
16699503
16728531
16728974
16731528
16734381
16738318
16762839
16766265
16787918
16820529
16838299
16865259
16870149
16914725
16914734
16919237
16959611
16960727
16963455
16964284
16982778
17000776
17005678
17008050
17022812
17056544
17074803
17081983
17158748
17172643
17182846
17239852
17245431
17255935
17273746
17304221
17311813
17312152
17314511
17318229
17353187
17353261
17369852
17371797
17371848
17373667
17389244
17395887
17412698
17452459
17468742
17470557
17474147
17487425
17540176
17548428
17573780
17609203
17620012
17630394
17634443
17636019
17643391
17663720
17670825
17707923
17786334
17827154
17850504
17894944
17895379
17897615
17906119
17910034
17922035
17923479
17932104
17934516
17935135
17938259
17961987
17962807
17967891
17980157
17996965
18003922
18004079
18029348
18037904
18059533
18067919
18093978
18156491
18172012
18182442
18193082
18206970
18212746
18241676
18245468
18271930
18316616
18326024
18333962
18342621
18347167
18362831
18372343
18391013
18408217
18413351
18439917
18451880
18485871
18501190
18552382
18585351
18588874
18619497
18634613
18644863
18644983
18671804
18708058
18714364
18722353
18765668
18781797
18789002
18806873
18822204
18850004
18850007
18851995
18854154
18854353
18936100
18948152
18974119
19011633
19015268
19029947
19041848
19049980
19061646
19062177
19064572
19070599
19081374
19081376
19099586
19101520
19124609
19166851
19182791
19218564
19235719
19244234
19252524
19339282
19339613
19343227
19351825
19383825
19394292
19416910
19424621
19433865
19438744
19454010
19471022
19497860
19503603
19505873
19531758
19561124
19561196
19581286
19581932
19617623
19644445
19648967
19683447
19686092
19703393
19729656
19738201
19738286
19740981
19759913
19786833
19793920
19800870
19801684
19802013
19819149
19819974
19822520
19828482
19855430
19912635
19995069
20001970
20022962
20037577
20037816
20049841
20072153
20075864
20081843
20124407
20127688
20144149
20154723
20185822
20331966
20332121
20360311
20379614
20385359
20388487
20398369
20400511
20415600
20438716
20464640
20471948
20473547
20478393
20484017
20498639
20508642
20523938
20561418
20562920
20585571
20585871
20590529
20596014
20603076
20609223
20613874
20633551
20680269
20693977
20702731
20731616
20802485
20821348
20856864
20935208
20967026
20972266
21030595
21045206
21059642
21081666
21106524
21108932
21123453
21127047
21139048
21143702
21148070
21151932
21176959
21179169
21179472
21182205
21184735
21252314
21258344
21262769
21262773
21293853
21301206
21344388
21420382
21423269
21438903
21454521
21455583
21457345
21466904
21502505
21527555
21532573
21549307
21565167
21566081
21566083
21617866
21622623
21636851
21637537
21638299
21661415
21666599
21669392
21669397
21670149
21685935
21693764
21718540
21725353
21725604
21846774
21890473
21900881
21906983
21907836
21937684
21952639
21957129
21963094
21972094
21972143
21974802
21982637
21983014
21987572
21988832
21996064
22028823
22036763
22037263
22053931
22056872
22075476
22077140
22100169
22113938
22114073
22116549
22143567
22156779
22180294
22184063
22211246
22222205
22242125
22266186
22274925
22286234
22325352
22344732
22355045
22393235
22411829
22416134
22419072
22439931
22496786
22498736
22505724
22542627
22641068
22733990
22750444
22778253
22796363
22797919
22822071
22863883
22865885
22879913
22927334
22939629
22939983
22982681
22989952
23000965
23011797
23014989
23022380
23060449
23104175
23110995
23140481
23185513
23217559
23242655
23246564
23251689
23280436
23362263
23437037
23612983
23690335
23708667
23714156
23752268
23791785
23803414
23926105
23932364
23939379
24015760
24036913
24068740
24086750
24116224
24176859
24190971
24307847
24316511
24344198
24457600
24550390
24654937
24816145
24821727

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007596  blood coagulation
GO:0016568  chromatin modification
GO:0006338  chromatin remodeling
GO:0042733  embryonic digit morphogenesis
GO:0009913  epidermal cell differentiation
GO:0010467  gene expression
GO:0060789  hair follicle placode formation
GO:0016575  histone deacetylation
GO:0070932  histone H3 deacetylation
GO:0070933  histone H4 deacetylation
GO:0000278  mitotic cell cycle
GO:0043922  negative regulation by host of viral transcription
GO:0060766  negative regulation of androgen receptor signaling pathway
GO:0043066  negative regulation of apoptosis
GO:0045786  negative regulation of cell cycle
GO:0010832  negative regulation of myotube differentiation
GO:0000122  negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045892  negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0048011  nerve growth factor receptor signaling pathway
GO:0007219  Notch signaling pathway
GO:0042475  odontogenesis of dentine-containing tooth
GO:0008284  positive regulation of cell proliferation
GO:0010870  positive regulation of receptor biosynthetic process
GO:0045944  positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045893  positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006476  protein amino acid deacetylation
GO:0006367  transcription initiation from RNA polymerase II promoter
GO:0006351  transcription, DNA-dependent
GO:0007179  transforming growth factor beta receptor signaling pathway
GO:0019048  virus-host interaction

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005829  cytosol
GO:0000118  histone deacetylase complex
GO:0000790  nuclear chromatin
GO:0005730  nucleolus
GO:0005654  nucleoplasm
GO:0005634  nucleus
GO:0016581  NuRD complex
GO:0016580  Sin3 complex

Molecular Function

GO:0019899  enzyme binding
GO:0004407  histone deacetylase activity
GO:0042826  histone deacetylase binding
GO:0032041  NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K14 specific)
GO:0046969  NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K9 specific)
GO:0046970  NAD-dependent histone deacetylase activity (H4-K16 specific)
GO:0005515  protein binding
GO:0033558  protein deacetylase activity
GO:0033613  transcription activator binding
GO:0003700  transcription factor activity
GO:0008134  transcription factor binding