histone deacetylase 2

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同義遺伝子名

HD2, YAF1, HDAC2, Histone deacetylase 2, histone deacetylase 2

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:36.70

小脳:37.80

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:148.30

末梢神経:61.30

脊柱:112.30

網膜:237.30

目:94

動脈:30

静脈:-

リンパ節:50.60

末梢血:72.90

脾臓:18.90

胸腺:116

骨髄:275.50

脂肪:-

骨:25.60

皮膚:129.60

GeneChip

大脳:6.74

小脳:6.61

脳幹:6.82

脳梁:6.84

松果体:-

末梢神経:6.79

脊柱:6.63

網膜:-

目:-

動脈:6.84

静脈:6.64

リンパ節:6.89

末梢血:-

脾臓:6.83

胸腺:7.87

骨髄:6.81

脂肪:6.73

骨:-

皮膚:6.94

CAGE

大脳:3.92

小脳:-

脳幹:4.00

脳梁:3.89

松果体:3.96

末梢神経:-

脊柱:4.05

網膜:-

目:-

動脈:3.78

静脈:3.97

リンパ節:4.01

末梢血:-

脾臓:4.03

胸腺:4.58

骨髄:-

脂肪:3.86

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.17

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.30

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:3.34

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:145.80

胎盤:25.50

前立腺:45.10

卵巣:-

精巣:199

心臓:25.50

骨格筋:60.30

食道:-

胃:297.40

腸:-

結腸:50.90

肝臓:137.20

肺:83.10

膀胱:-

腎臓:31.20

下垂体:-

甲状腺:163.70

副腎:-

膵臓:124.50

乳腺:102.20

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.51

胎盤:7.33

前立腺:7.33

卵巣:7.50

精巣:7.95

心臓:6.84

骨格筋:6.67

食道:6.92

胃:6.88

腸:6.88

結腸:6.09

肝臓:5.90

肺:6.64

膀胱:-

腎臓:6.56

下垂体:7.29

甲状腺:6.89

副腎:7.06

膵臓:6.91

乳腺:6.73

唾液腺:6.42

CAGE

子宮:4.08

胎盤:4.18

前立腺:4.12

卵巣:4.29

精巣:4.58

心臓:4.08

骨格筋:4.06

食道:4.05

胃:-

腸:3.86

結腸:3.83

肝臓:3.53

肺:4.15

膀胱:4.11

腎臓:4.04

下垂体:4.31

甲状腺:4.11

副腎:-

膵臓:3.84

乳腺:4.76

唾液腺:3.32

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.85

卵巣:4.35

精巣:4.99

心臓:2.54

骨格筋:2.64

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:4.24

肝臓:2.14

肺:3.30

膀胱:-

腎臓:3.62

下垂体:-

甲状腺:3.65

副腎:3.45

膵臓:-

乳腺:3.35

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001527
Gene ID	3066
Unigene ID	Hs.335239
Probe set ID	201833_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000196591
GTEx ID	ENSG00000196591

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_008229
ラット[1]	NM_053447

染色体

6q21 [114,254,192 - 114,332,472]

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遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003084	Histone deacetylase
IPR000286	Histone deacetylase superfamily

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007596	blood coagulation
GO:0055013	cardiac muscle cell development
GO:0006338	chromatin remodeling
GO:0016358	dendrite development
GO:0042733	embryonic digit morphogenesis
GO:0009913	epidermal cell differentiation
GO:0060789	hair follicle placode formation
GO:0021766	hippocampus development
GO:0016575	histone deacetylation
GO:0006344	maintenance of chromatin silencing
GO:0043066	negative regulation of apoptosis
GO:0060044	negative regulation of cardiac muscle cell proliferation
GO:0045786	negative regulation of cell cycle
GO:0045347	negative regulation of MHC class II biosynthetic process
GO:0010977	negative regulation of neuron projection development
GO:0043433	negative regulation of transcription factor activity
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045892	negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0090090	negative regulation of Wnt receptor signaling pathway through beta-catenin
GO:0048011	nerve growth factor receptor signaling pathway
GO:0042475	odontogenesis of dentine-containing tooth
GO:0008284	positive regulation of cell proliferation
GO:0032967	positive regulation of collagen biosynthetic process
GO:0048714	positive regulation of oligodendrocyte differentiation
GO:0045862	positive regulation of proteolysis
GO:0010870	positive regulation of receptor biosynthetic process
GO:0051091	positive regulation of transcription factor activity
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045893	positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0051896	regulation of protein kinase B signaling cascade
GO:0060297	regulation of sarcomere organization
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0035098	ESC/E(Z) complex
GO:0000792	heterochromatin
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0016581	NuRD complex
GO:0005657	replication fork
GO:0016580	Sin3 complex
GO:0005667	transcription factor complex

Molecular Function

GO:0003682	chromatin binding
GO:0031490	chromatin DNA binding
GO:0019899	enzyme binding
GO:0004407	histone deacetylase activity
GO:0032041	NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K14 specific)
GO:0046969	NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K9 specific)
GO:0046970	NAD-dependent histone deacetylase activity (H4-K16 specific)
GO:0005515	protein binding
GO:0033558	protein deacetylase activity
GO:0043565	sequence-specific DNA binding
GO:0003700	transcription factor activity
GO:0008134	transcription factor binding

histone deacetylase 2

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function