SRY (sex determining region Y)-box 8

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同義遺伝子名

Transcription factor SOX-8, SRY (sex determining region Y)-box 8, MGC24837, SOX8

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:32 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:92 脊柱:- 網膜:- 目:29.40 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip nodata
CAGE 大脳:3.42 小脳:- 脳幹:3.91 脳梁:4.68 松果体:1.21 末梢神経:- 脊柱:3.44 網膜:- 目:- 動脈:1.48 静脈:1.34 リンパ節:0.79 末梢血:- 脾臓:0.45 胸腺:0.50 骨髄:- 脂肪:0.14 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.94 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.32 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.54 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:22.50 卵巣:- 精巣:4.30 心臓:12.80 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:9.30 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:0.32 胎盤:0.16 前立腺:0.49 卵巣:0.07 精巣:0.47 心臓:0.76 骨格筋:0.17 食道:0.52 胃:- 腸:0.27 結腸:0.84     肝臓:0    肺:0 膀胱:0.58 腎臓:0.15 下垂体:0.50 甲状腺:0.06 副腎:- 膵臓:0 乳腺:0 唾液腺:2.22
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.80 卵巣:0.35 精巣:1.68 心臓:0.16 骨格筋:0.24 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.72     肝臓:0.03        肺:0.45    膀胱:- 腎臓:0.19 下垂体:- 甲状腺:0.25 副腎:1.80 膵臓:- 乳腺:0.66 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_014587
Gene ID 30812
Unigene ID Hs.243678
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000005513
GTEx ID ENSG00000005513

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_011447
ラット[1]  NM_001106989

染色体

16p13.3  [1,031,808  -  1,036,979]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000910  High mobility group, HMG1/HMG2
IPR009071  High mobility group, superfamily

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10662550
10684944
11157797
11483257
12477932
12665801
12732652
14702039
15489334
15616553
16582099
18492098
18512230
19369635
20211142
21532573
21833088
21890473
21906983
21988832
23000965
23739915

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0060612  adipose tissue development
GO:0060018  astrocyte fate commitment
GO:0045165  cell fate commitment
GO:0048469  cell maturation
GO:0048484  enteric nervous system development
GO:0045444  fat cell differentiation
GO:0001701  in utero embryonic development
GO:0008584  male gonad development
GO:0043066  negative regulation of apoptosis
GO:0045662  negative regulation of myoblast differentiation
GO:0046533  negative regulation of photoreceptor cell differentiation
GO:0045892  negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0001755  neural crest cell migration
GO:0048709  oligodendrocyte differentiation
GO:0001649  osteoblast differentiation
GO:0007422  peripheral nervous system development
GO:0090190  positive regulation of branching involved in ureteric bud morphogenesis
GO:0014015  positive regulation of gliogenesis
GO:0090184  positive regulation of kidney development
GO:0033690  positive regulation of osteoblast proliferation
GO:0045944  positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045893  positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0010817  regulation of hormone levels
GO:0060041  retina development in camera-type eye
GO:0060221  retinal rod cell differentiation
GO:0060009  Sertoli cell development
GO:0007165  signal transduction
GO:0007283  spermatogenesis
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0003677  DNA binding
GO:0003700  transcription factor activity
GO:0008134  transcription factor binding