CXXC finger 1 (PHD domain)

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同義遺伝子名

CXXC finger 1 (PHD domain), CGBP, CpG-binding protein, 2410002I16Rik, HsT2645, PHF18, CXXC-type zinc finger protein 1, 5830420C16Rik, PCCX1, PHD finger and CXXC domain-containing protein 1, hCGBP, CXXC1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:54.50 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:148.30 末梢神経:92 脊柱:224.60 網膜:- 目:58.80 動脈:- 静脈:- リンパ節:141.50 末梢血:127.50 脾臓:56.70 胸腺:38.70 骨髄:19.70 脂肪:40.30 骨:12.80 皮膚:33.60
GeneChip 大脳:8.80 小脳:9.17 脳幹:8.72 脳梁:8.92 松果体:- 末梢神経:8.75 脊柱:8.73 網膜:- 目:- 動脈:9.04 静脈:8.75 リンパ節:9.37 末梢血:- 脾臓:9.21 胸腺:9.21 骨髄:9.18 脂肪:8.83 骨:- 皮膚:9.07
CAGE 大脳:3.15 小脳:- 脳幹:3.27 脳梁:3.21 松果体:3.13 末梢神経:- 脊柱:2.84 網膜:- 目:- 動脈:2.93 静脈:3.63 リンパ節:3.01 末梢血:- 脾臓:3.04 胸腺:3.46 骨髄:- 脂肪:2.77 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.05 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.73 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.53 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:18.20 胎盤:40.10 前立腺:33.80 卵巣:186.30 精巣:95.20 心臓:25.50 骨格筋:20.10 食道:- 胃:85 腸:- 結腸:59.40     肝臓:21.10        肺:29.30    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:50.80 膵臓:62.20 乳腺:46.50 唾液腺:-
GeneChip 子宮:8.92 胎盤:8.79 前立腺:8.93 卵巣:8.89 精巣:9.12 心臓:8.55 骨格筋:8.36 食道:8.89 胃:9.14 腸:8.74 結腸:8.94 肝臓:8.86 肺:8.93 膀胱:- 腎臓:9.11 下垂体:9.23 甲状腺:9.26 副腎:9.32 膵臓:8.65 乳腺:8.98 唾液腺:9.05
CAGE 子宮:3.26 胎盤:3.43 前立腺:3.18 卵巣:2.98 精巣:3.15 心臓:2.72 骨格筋:2.55 食道:2.97 胃:- 腸:2.93 結腸:3.05     肝臓:2.60    肺:2.67 膀胱:2.86 腎臓:2.89 下垂体:2.84 甲状腺:3.08 副腎:- 膵臓:3.10 乳腺:1.80 唾液腺:3.52
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.43 卵巣:3.42 精巣:3.18 心臓:1.52 骨格筋:1.98 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.65     肝臓:2.19        肺:2.42    膀胱:- 腎臓:3.01 下垂体:- 甲状腺:3.20 副腎:3.12 膵臓:- 乳腺:2.40 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_014593
Gene ID 30827
Unigene ID Hs.180933
Probe set ID 48580_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000154832
GTEx ID ENSG00000154832

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_028868
ラット[1]  NM_001079698

染色体

18q21.1  [47,808,713  -  47,814,692]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR019787  Zinc finger, PHD-finger
IPR001965  Zinc finger, PHD-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10688657
10799292
11230166
11256614
11572867
11604496
12200428
12477932
15489334
15761153
16253997
16713569
17328666
17355966
17998332
18082152
18680430
18838538
19433449
19454010
19951360
20211142
20305087
20516061
21252943
21407193
22321011
22623531
22939624
22939629
23851690
24250222
24457600
24703950
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006987  activation of signaling protein activity involved in unfolded protein response
GO:0044267  cellular protein metabolic process
GO:0030968  endoplasmic reticulum unfolded protein response
GO:0051568  histone H3-K4 methylation
GO:0045893  positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0035097  histone methyltransferase complex
GO:0016363  nuclear matrix
GO:0016607  nuclear speck
GO:0005654  nucleoplasm
GO:0005634  nucleus
GO:0048188  Set1C/COMPASS complex

Molecular Function

GO:0042800  histone methyltransferase activity (H3-K4 specific)
GO:0005515  protein binding
GO:0045322  unmethylated CpG binding
GO:0008270  zinc ion binding