3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-Coenzyme A lyase

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同義遺伝子名

3-hydroxy-3-methylglutarate-CoA lyase, HMGCL, HMG-CoA lyase

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:34.40 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:237.30 目:111.70 動脈:30 静脈:- リンパ節:30.30 末梢血:218.60 脾臓:132.30 胸腺:12.90 骨髄:78.70 脂肪:80.70 骨:38.40 皮膚:48
GeneChip 大脳:7.08 小脳:6.89 脳幹:7.24 脳梁:7.27 松果体:- 末梢神経:7.31 脊柱:7.62 網膜:- 目:- 動脈:7.57 静脈:7.40 リンパ節:7.34 末梢血:- 脾臓:7.21 胸腺:7.15 骨髄:7.17 脂肪:7.74 骨:- 皮膚:7.36
CAGE 大脳:2.25 小脳:- 脳幹:2.48 脳梁:2.71 松果体:2.33 末梢神経:- 脊柱:2.54 網膜:- 目:- 動脈:2.89 静脈:2.39 リンパ節:2.74 末梢血:- 脾臓:2.63 胸腺:2.43 骨髄:- 脂肪:2.50 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.07 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.19 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.89 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:63.80 胎盤:102 前立腺:123.90 卵巣:37.30 精巣:51.90 心臓:51.10 骨格筋:40.20 食道:- 胃:- 腸:162 結腸:59.40     肝臓:95        肺:48.90    膀胱:- 腎臓:291.10 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:50.80 膵臓:44.50 乳腺:65.10 唾液腺:-
GeneChip 子宮:7.41 胎盤:7.45 前立腺:7.99 卵巣:7.65 精巣:7.41 心臓:7.64 骨格筋:8.38 食道:7.75 胃:7.49 腸:7.85 結腸:7.89 肝臓:9.55 肺:7.39 膀胱:- 腎臓:8.54 下垂体:7.57 甲状腺:7.94 副腎:7.93 膵臓:7.90 乳腺:7.65 唾液腺:7.74
CAGE 子宮:2.40 胎盤:2.62 前立腺:2.60 卵巣:2.39 精巣:2.57 心臓:2.62 骨格筋:2.68 食道:2.72 胃:- 腸:3.14 結腸:3.21     肝臓:4.55    肺:2.67 膀胱:2.60 腎臓:3.29 下垂体:2.42 甲状腺:3.10 副腎:- 膵臓:3.13 乳腺:3.16 唾液腺:2.80
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:4.34 卵巣:3.96 精巣:3.62 心臓:2.79 骨格筋:2.38 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:3.85     肝臓:6.25        肺:3.02    膀胱:- 腎臓:5.01 下垂体:- 甲状腺:4.92 副腎:3.97 膵臓:- 乳腺:4.02 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_000191
Gene ID 3155
Unigene ID Hs.533444
Probe set ID 202772_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000117305
GTEx ID ENSG00000117305

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_008254
ラット [0]  

染色体

1p36.11  [24,128,375  -  24,165,110]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR013785  Aldolase-type TIM barrel
IPR000891  Pyruvate carboxyltransferase

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

2116546
7527399
8027038
8102917
8440722
8617516
8670134
8798725
8889548
8978493
9200711
9463337
9869651
11129331
11952809
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12477932
14702039
15122894
15164951
15489334
15752612
15764642
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16330550
16344560
17173698
17459752
19036343
19177531
19932602
20178365
20301313
20558737
20877624
21514269
21900206
21952825
21988832
22865860
23465862
24333427

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006637  acyl-CoA metabolic process
GO:0046950  cellular ketone body metabolic process
GO:0044255  cellular lipid metabolic process
GO:0009790  embryonic development
GO:0046951  ketone body biosynthetic process
GO:0006552  leucine catabolic process
GO:0001889  liver development
GO:0007005  mitochondrion organization
GO:0051262  protein tetramerization
GO:0070542  response to fatty acid
GO:0007584  response to nutrient
GO:0042594  response to starvation

Cellular Component

GO:0005743  mitochondrial inner membrane
GO:0005759  mitochondrial matrix
GO:0005739  mitochondrion
GO:0005777  peroxisome

Molecular Function

GO:0000062  acyl-CoA binding
GO:0031406  carboxylic acid binding
GO:0004419  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase activity
GO:0000287  magnesium ion binding
GO:0030145  manganese ion binding
GO:0046872  metal ion binding
GO:0042803  protein homodimerization activity
GO:0005102  receptor binding