3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A synthase 1 (soluble)

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同義遺伝子名

HMGCS1, HMG-CoA synthase, 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A synthase, MGC90332, Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, cytoplasmic, HMGCS

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:282.10 小脳:75.60 脳幹:- 脳梁:29.20 松果体:- 末梢神経:153.40 脊柱:673.80 網膜:118.60 目:41.10 動脈:60 静脈:- リンパ節:131.40 末梢血:91.10 脾臓:56.70 胸腺:77.30 骨髄:19.70 脂肪:- 骨:51.20 皮膚:153.60
GeneChip 大脳:7.28 小脳:6.29 脳幹:7.46 脳梁:6.93 松果体:- 末梢神経:8.17 脊柱:7.79 網膜:- 目:- 動脈:6.36 静脈:5.90 リンパ節:6.46 末梢血:- 脾臓:5.81 胸腺:6.12 骨髄:4.78 脂肪:6.38 骨:- 皮膚:7.66
CAGE 大脳:3.70 小脳:- 脳幹:4.06 脳梁:4.04 松果体:3.01 末梢神経:- 脊柱:4.27 網膜:- 目:- 動脈:2.69 静脈:2.39 リンパ節:3.41 末梢血:- 脾臓:2.61 胸腺:2.36 骨髄:- 脂肪:2.25 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:5.51 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.21 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.09 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:54.70 胎盤:65.60 前立腺:56.30 卵巣:- 精巣:86.50 心臓:51.10 骨格筋:20.10 食道:- 胃:63.70 腸:129.60 結腸:42.40     肝臓:253.30        肺:161.30    膀胱:125.60 腎臓:83.20 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:50.80 膵臓:35.60 乳腺:37.20 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.54 胎盤:6.33 前立腺:7.72 卵巣:6.59 精巣:6.63 心臓:5.90 骨格筋:5.43 食道:8.09 胃:6.74 腸:6.89 結腸:6.24 肝臓:8.09 肺:6.73 膀胱:- 腎臓:6.02 下垂体:6.30 甲状腺:6.15 副腎:7.78 膵臓:5.51 乳腺:6.83 唾液腺:5.73
CAGE 子宮:3.29 胎盤:2.64 前立腺:2.76 卵巣:3.91 精巣:3.13 心臓:2.39 骨格筋:1.29 食道:5.15 胃:- 腸:4.04 結腸:2.69     肝臓:4.37    肺:4.60 膀胱:3.16 腎臓:3.55 下垂体:2.82 甲状腺:2.50 副腎:- 膵臓:2.76 乳腺:3.30 唾液腺:2.78
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.36 卵巣:5.65 精巣:3.65 心臓:1.43 骨格筋:0.00 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.80     肝臓:6.27        肺:5.52    膀胱:- 腎臓:4.38 下垂体:- 甲状腺:4.01 副腎:3.57 膵臓:- 乳腺:3.56 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_002130
Gene ID 3157
Unigene ID Hs.397729
Probe set ID 221750_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000112972
GTEx ID ENSG00000112972

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]  NM_145942
ラット [0]  

染色体

5p12  [43,289,497  -  43,313,614]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1358203
1971108
2870496
2877984
3470763
7913309
12477932
14702039
15489334
16344560
17081983
18029348
18636124
18660489
18854154
19088433
20346956
21139048
21890473
21906983
21963094
22053931
22505724
22939629
23000965
23464991
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007420  brain development
GO:0044255  cellular lipid metabolic process
GO:0071397  cellular response to cholesterol
GO:0071372  cellular response to follicle-stimulating hormone stimulus
GO:0006695  cholesterol biosynthetic process
GO:0008299  isoprenoid biosynthetic process
GO:0006629  lipid metabolic process
GO:0001889  liver development
GO:0008584  male gonad development
GO:0001101  response to acid
GO:0042493  response to drug
GO:0055094  response to lipoprotein stimulus
GO:0009645  response to low light intensity stimulus
GO:0014074  response to purine
GO:0046690  response to tellurium ion
GO:0033197  response to vitamin E

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005829  cytosol
GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0008144  drug binding
GO:0004421  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase activity
GO:0016853  isomerase activity
GO:0043177  organic acid binding
GO:0042803  protein homodimerization activity