high mobility group AT-hook 1

同義遺伝子名

MGC12816, High mobility group protein-R, high mobility group AT-hook 1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, HMG-I(Y), MGC4854, HMGA1, HMG-R, High mobility group AT-hook protein 1, MGC4242, HMGIY, High mobility group protein A1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

nodata

GeneChip

大脳:6.66

小脳:6.53

脳幹:6.61

脳梁:6.14

松果体:-

末梢神経:6.52

脊柱:6.35

網膜:-

目:-

動脈:6.56

静脈:6.39

リンパ節:8.17

末梢血:-

脾臓:7.13

胸腺:8.38

骨髄:8.32

脂肪:6.74

骨:-

皮膚:7.83

CAGE

大脳:0.56

小脳:-

脳幹:0.60

脳梁:0.52

松果体:0.83

末梢神経:-

脊柱:0.82

網膜:-

目:-

動脈:0.47

静脈:0.96

リンパ節:0.80

末梢血:-

脾臓:0.25

胸腺:1.61

骨髄:-

脂肪:0.46

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.69

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.56

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

nodata

GeneChip

子宮:6.15

胎盤:7.37

前立腺:6.14

卵巣:6

精巣:8.86

心臓:6.37

骨格筋:6.92

食道:9.04

胃:7.30

腸:7.37

結腸:7.78

肝臓:6.04

肺:6.67

膀胱:-

腎臓:6.26

下垂体:6.11

甲状腺:6.91

副腎:5.71

膵臓:6.34

乳腺:7.52

唾液腺:7.33

CAGE

子宮:0.49

胎盤:1.30

前立腺:0.44

卵巣:0.07

精巣:1.70

心臓:0.68

骨格筋:0.86

食道:0.94

胃:-

腸:1.22

結腸:0.97

肝臓:0

肺:0.42

膀胱:0.58

腎臓:0.27

下垂体:0.34

甲状腺:0.37

副腎:-

膵臓:1.21

乳腺:0

唾液腺:0.83

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.00

卵巣:0.08

精巣:0.55

心臓:0.00

骨格筋:1.37

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.44

肝臓:0.00

肺:0.26

膀胱:-

腎臓:0.01

下垂体:-

甲状腺:0.29

副腎:0.26

膵臓:-

乳腺:0.33

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_002131
Gene ID	3159
Unigene ID	-
Probe set ID	206074_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000137309
GTEx ID	ENSG00000137309

オーソログ対応遺伝子

マウス[29]	NM_001025427, NM_001039356, NM_001166535, NM_001166536, NM_001166537, NM_001166539, NM_001166540, NM_001166541, NM_001166542, NM_001166543, NM_001166544, NM_001166545, NM_001166546, NM_016660, NM_001166476
ラット[1]	NM_139327, NM_001039356, NM_001166535, NM_001166536, NM_001166537, NM_001166539, NM_001166540, NM_001166541, NM_001166542, NM_001166543, NM_001166544, NM_001166545, NM_001166546, NM_016660, NM_001166476

染色体

6p21.31 [34,204,577 - 34,214,008]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR020478	A.T hook-like
IPR017956	AT hook, DNA-binding motif
IPR000116	High mobility group, HMG-I/HMG-Y

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006284	base-excision repair
GO:0006268	DNA unwinding during replication
GO:0008285	negative regulation of cell proliferation
GO:0031936	negative regulation of chromatin silencing
GO:0045892	negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006337	nucleosome disassembly
GO:0045893	positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006461	protein complex assembly
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0009615	response to virus
GO:0006351	transcription, DNA-dependent
GO:0016032	viral reproduction
GO:0019048	virus-host interaction

Cellular Component

GO:0005829	cytosol
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0005667	transcription factor complex

Molecular Function

GO:0051575	5'-deoxyribose-5-phosphate lyase activity
GO:0003680	AT DNA binding
GO:0003677	DNA binding
GO:0003906	DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase activity
GO:0019899	enzyme binding
GO:0030374	ligand-dependent nuclear receptor transcription coactivator activity
GO:0042975	peroxisome proliferator activated receptor binding
GO:0005515	protein binding
GO:0042974	retinoic acid receptor binding
GO:0046965	retinoid X receptor binding
GO:0003700	transcription factor activity
GO:0008134	transcription factor binding

high mobility group AT-hook 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function