homeobox A1

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同義遺伝子名

homeo box A1, Homeobox protein Hox-A1, BSAS, HOXA1, Hox-1F, homeobox A1, HOX1F, MGC45232

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:7.10

小脳:-

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:36.40

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:12.80

皮膚:-

GeneChip

大脳:3.75

小脳:3.88

脳幹:3.83

脳梁:3.74

松果体:-

末梢神経:4.01

脊柱:4.16

網膜:-

目:-

動脈:3.77

静脈:4.16

リンパ節:3.84

末梢血:-

脾臓:4.04

胸腺:3.40

骨髄:3.76

脂肪:4.14

骨:-

皮膚:4.30

CAGE

大脳:0.04

小脳:-

脳幹:0.50

脳梁:0.24

松果体:0

末梢神経:-

脊柱:1.23

網膜:-

目:-

動脈:1.10

静脈:0.59

リンパ節:1.01

末梢血:-

脾臓:1.60

胸腺:0.77

骨髄:-

脂肪:0.55

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.02

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.34

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.23

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:4.30

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:4.90

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:3.58

胎盤:3.77

前立腺:3.60

卵巣:3.81

精巣:3.50

心臓:3.92

骨格筋:4.03

食道:4.24

胃:4.01

腸:3.84

結腸:4.41

肝臓:3.85

肺:3.50

膀胱:-

腎臓:4.17

下垂体:3.55

甲状腺:3.37

副腎:3.80

膵臓:3.86

乳腺:4.13

唾液腺:3.76

CAGE

子宮:0.52

胎盤:0.37

前立腺:1.06

卵巣:1.08

精巣:0.53

心臓:0.20

骨格筋:0.17

食道:1.64

胃:-

腸:0.93

結腸:0.84

肝臓:0.14

肺:0.35

膀胱:1.32

腎臓:0.82

下垂体:0

甲状腺:0.23

副腎:-

膵臓:0.58

乳腺:0.90

唾液腺:0.36

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.00

卵巣:0.24

精巣:0.10

心臓:0.07

骨格筋:0

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.37

肝臓:0.10

肺:0.25

膀胱:-

腎臓:0.14

下垂体:-

甲状腺:0.01

副腎:0.52

膵臓:-

乳腺:0.31

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_153620
Gene ID	3198
Unigene ID	Hs.67397
Probe set ID	214639_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000105991
GTEx ID	ENSG00000105991

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_010449
ラット [0]

染色体

7p15.2 [27,132,612 - 27,135,615]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001356	Homeobox
IPR009057	Homeodomain-like
IPR012287	Homeodomain-related

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0021599	abducens nerve formation
GO:0009653	anatomical structure morphogenesis
GO:0009952	anterior/posterior pattern formation
GO:0060840	artery development
GO:0048844	artery morphogenesis
GO:0021953	central nervous system neuron differentiation
GO:0090102	cochlea development
GO:0090103	cochlea morphogenesis
GO:0050890	cognition
GO:0048702	embryonic neurocranium morphogenesis
GO:0021612	facial nerve structural organization
GO:0021754	facial nucleus development
GO:0048839	inner ear development
GO:0008045	motor axon guidance
GO:0007275	multicellular organismal development
GO:0050905	neuromuscular process
GO:0007634	optokinetic behavior
GO:0042473	outer ear morphogenesis
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0050795	regulation of behavior
GO:0021569	rhombomere 3 development
GO:0021570	rhombomere 4 development
GO:0021571	rhombomere 5 development
GO:0060876	semicircular canal formation
GO:0007605	sensory perception of sound
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005634

nucleus

Molecular Function

GO:0005515	protein binding
GO:0043565	sequence-specific DNA binding
GO:0003700	transcription factor activity

homeobox A1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function