homeobox D3

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同義遺伝子名

homeo box D3, MGC10470, Hox-4.1, HOX4A, Homeobox protein Hox-D3, HOX1D, homeobox D3, Hox-4A, HOXD3

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:1.20 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:5.90 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:4.80
GeneChip 大脳:3.64 小脳:3.60 脳幹:3.98 脳梁:3.51 松果体:- 末梢神経:3.82 脊柱:4.19 網膜:- 目:- 動脈:3.71 静脈:3.70 リンパ節:3.79 末梢血:- 脾臓:3.56 胸腺:3.27 骨髄:3.77 脂肪:3.96 骨:- 皮膚:3.79
CAGE 大脳:0.00 小脳:- 脳幹:0.15 脳梁:0.13 松果体:0 末梢神経:- 脊柱:2.55 網膜:- 目:- 動脈:2.39 静脈:1.83 リンパ節:0.80 末梢血:- 脾臓:1.62 胸腺:0.12 骨髄:- 脂肪:2.51 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.02 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.68 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.58 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:9.10 胎盤:- 前立腺:11.30 卵巣:- 精巣:4.30 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:8.50     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:135.20 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:4.48 胎盤:4.03 前立腺:3.61 卵巣:4.89 精巣:3.88 心臓:3.59 骨格筋:4.01 食道:3.63 胃:3.56 腸:3.55 結腸:3.97 肝臓:3.53 肺:3.59 膀胱:- 腎臓:5.33 下垂体:3.48 甲状腺:3.55 副腎:3.79 膵臓:3.61 乳腺:3.84 唾液腺:3.48
CAGE 子宮:3.36 胎盤:0.64 前立腺:1.77 卵巣:2.62 精巣:2.15 心臓:0.72 骨格筋:0.99 食道:1.23 胃:- 腸:0.57 結腸:2.91     肝臓:0.14    肺:0.45 膀胱:1.54 腎臓:2.45 下垂体:0 甲状腺:0.28 副腎:- 膵臓:0.58 乳腺:3.60 唾液腺:0
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.94 卵巣:1.50 精巣:1.38 心臓:0.09 骨格筋:0 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.32     肝臓:0        肺:0    膀胱:- 腎臓:1.89 下垂体:- 甲状腺:0.24 副腎:1.17 膵臓:- 乳腺:0.75 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_006898
Gene ID 3232
Unigene ID Hs.93574
Probe set ID 206601_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000128652
GTEx ID ENSG00000128652

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_010468
ラット[1]  NM_010468

染色体

2q31.1  [177,001,340  -  177,039,577]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001356  Homeobox
IPR009057  Homeodomain-like
IPR012287  Homeodomain-related

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1358204
1358459
1712489
1973146
2574852
2576652
2886047
7742539
7913891
8890171
9520319
10364522
10648567
11060466
11857506
12405287
12477932
12836255
14610084
14633614
15489334
15545924
17126050
17785556
19283074
19453261
19938081
20211142
20212450
20852632
21207416
22935821
23088713
23382691
24847526

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0009952  anterior/posterior pattern formation
GO:0051216  cartilage development
GO:0007160  cell-matrix adhesion
GO:0048704  embryonic skeletal system morphogenesis
GO:0021615  glossopharyngeal nerve morphogenesis
GO:0007219  Notch signaling pathway
GO:0010628  positive regulation of gene expression
GO:0045666  positive regulation of neuron differentiation
GO:0030878  thyroid gland development
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0005515  protein binding
GO:0043565  sequence-specific DNA binding
GO:0003700  transcription factor activity