apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide 1

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同義遺伝子名

Apolipoprotein B mRNA-editing enzyme 1, BEDP, APOBEC-1, CDAR1, HEPR, C->U-editing enzyme APOBEC-1, APOBEC1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:- 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:37.80 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip 大脳:4.34 小脳:4.34 脳幹:4.41 脳梁:4.19 松果体:- 末梢神経:4.06 脊柱:4.30 網膜:- 目:- 動脈:4.45 静脈:4.27 リンパ節:4.06 末梢血:- 脾臓:3.92 胸腺:3.89 骨髄:4.44 脂肪:4.09 骨:- 皮膚:4.19
CAGE 大脳:0 小脳:- 脳幹:0 脳梁:0 松果体:0 末梢神経:- 脊柱:0 網膜:- 目:- 動脈:0 静脈:0 リンパ節:0 末梢血:- 脾臓:0 胸腺:0 骨髄:- 脂肪:0 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:4.30 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:4.02 胎盤:4.05 前立腺:3.77 卵巣:4.05 精巣:4.01 心臓:4.19 骨格筋:4.49 食道:4.05 胃:4.27 腸:5.19 結腸:4.38 肝臓:4.07 肺:3.91 膀胱:- 腎臓:4.14 下垂体:4.08 甲状腺:3.98 副腎:4.15 膵臓:4.58 乳腺:4.02 唾液腺:4.33
CAGE 子宮:0 胎盤:0 前立腺:0 卵巣:0 精巣:0 心臓:0 骨格筋:0 食道:0 胃:- 腸:4.29 結腸:1.61     肝臓:0    肺:0 膀胱:0 腎臓:0 下垂体:0 甲状腺:0 副腎:- 膵臓:0 乳腺:0 唾液腺:0
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0 卵巣:0 精巣:0.32 心臓:0 骨格筋:0 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0     肝臓:0.13        肺:0    膀胱:- 腎臓:0 下垂体:- 甲状腺:0.07 副腎:0.05 膵臓:- 乳腺:0 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001644
Gene ID 339
Unigene ID Hs.560000
Probe set ID 207158_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000111701
GTEx ID ENSG00000111701

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_001134391, NM_031159
ラット [0]  

染色体

12p13.31  [7,801,996  -  7,818,499]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7698776
7736571
8078915
8208612
8692961
8999813
8999814
9186903
9479499
10669759
10781591
11134005
11352648
11577082
11584023
11698249
11727199
11815617
12477932
12683974
12881431
12896982
14559896
15516966
15659357
15979078
16999936
17696929
18051367
18971252
19911124
19913121
19932086
19965785
20331378
20348446
20628086

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0032869  cellular response to insulin stimulus
GO:0009972  cytidine deamination
GO:0016554  cytidine to uridine editing
GO:0051607  defense response to virus
GO:0080111  DNA demethylation
GO:0010467  gene expression
GO:0006629  lipid metabolic process
GO:0042158  lipoprotein biosynthetic process
GO:0042953  lipoprotein transport
GO:0016556  mRNA modification
GO:0006397  mRNA processing
GO:0048255  mRNA stabilization
GO:0042127  regulation of cell proliferation
GO:0051592  response to calcium ion
GO:0042493  response to drug
GO:0045471  response to ethanol
GO:0010332  response to gamma radiation
GO:0006970  response to osmotic stress
GO:0010043  response to zinc ion
GO:0006396  RNA processing

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005654  nucleoplasm

Molecular Function

GO:0017091  AU-rich element binding
GO:0004126  cytidine deaminase activity
GO:0005515  protein binding
GO:0003723  RNA binding
GO:0008270  zinc ion binding