immunoglobulin mu binding protein 2

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同義遺伝子名

SMARD1, ATP-dependent helicase IGHMBP2, GF-1, DNA-binding protein SMUBP-2, SMUBP-2, Immunoglobulin mu-binding protein 2, Glial factor 1, SMUBP2, CATF1, SMBP2, IGHMBP2, FLJ34220, immunoglobulin mu binding protein 2, HCSA

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:45 小脳:113.30 脳幹:- 脳梁:145.80 松果体:- 末梢神経:30.70 脊柱:112.30 網膜:- 目:35.30 動脈:89.90 静脈:66.60 リンパ節:40.40 末梢血:- 脾臓:132.30 胸腺:103.10 骨髄:78.70 脂肪:40.30 骨:89.60 皮膚:28.80
GeneChip 大脳:7.60 小脳:7.81 脳幹:7.47 脳梁:7.54 松果体:- 末梢神経:7.62 脊柱:7.77 網膜:- 目:- 動脈:7.80 静脈:7.70 リンパ節:7.68 末梢血:- 脾臓:7.71 胸腺:7.61 骨髄:8.13 脂肪:7.80 骨:- 皮膚:7.63
CAGE 大脳:2.63 小脳:- 脳幹:2.21 脳梁:2.56 松果体:2.56 末梢神経:- 脊柱:1.89 網膜:- 目:- 動脈:2.94 静脈:2.39 リンパ節:2.37 末梢血:- 脾臓:2.15 胸腺:2.53 骨髄:- 脂肪:2.17 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.32 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.86 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.45 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:27.30 胎盤:7.30 前立腺:- 卵巣:74.50 精巣:147.10 心臓:12.80 骨格筋:40.20 食道:342.80 胃:21.20 腸:32.40 結腸:8.50     肝臓:21.10        肺:34.20    膀胱:125.60 腎臓:10.40 下垂体:- 甲状腺:327.50 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:7.59 胎盤:7.60 前立腺:7.45 卵巣:7.60 精巣:8.09 心臓:7.50 骨格筋:7.36 食道:7.72 胃:7.93 腸:7.66 結腸:7.93 肝臓:7.84 肺:7.64 膀胱:- 腎臓:7.72 下垂体:8.07 甲状腺:7.82 副腎:7.74 膵臓:7.78 乳腺:7.66 唾液腺:8.10
CAGE 子宮:2.72 胎盤:2.08 前立腺:2.35 卵巣:2.28 精巣:3.85 心臓:2.27 骨格筋:2.64 食道:2.39 胃:- 腸:2.26 結腸:2.76     肝臓:2.14    肺:2.10 膀胱:2.27 腎臓:2.24 下垂体:2.03 甲状腺:1.97 副腎:- 膵臓:2.54 乳腺:2.69 唾液腺:3.01
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.10 卵巣:1.54 精巣:3.74 心臓:1.11 骨格筋:2.41 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.58     肝臓:1.17        肺:1.36    膀胱:- 腎臓:1.46 下垂体:- 甲状腺:1.62 副腎:1.91 膵臓:- 乳腺:1.69 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_002180
Gene ID 3508
Unigene ID Hs.503048
Probe set ID 31861_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000132740
GTEx ID ENSG00000132740

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_009212
ラット[1]  NM_031586

染色体

11q13.3  [68,671,310  -  68,708,070]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003593  ATPase, AAA+ type, core
IPR014001  DEAD-like helicase, N-terminal
IPR014021  Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1714899
8349627
8493094
8619474
9110174
9439975
9507986
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11292846
11528396
12477932
12547203
14681881
14702039
15106121
15231747
15290238
15599641
15797190
16752224
16964485
18187479
18187620
18802676
19157874
19158098
19299493
19946888
20031928
20441787
22157136
22791546
22965130
22999958

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0008219  cell death
GO:0032508  DNA duplex unwinding
GO:0006310  DNA recombination
GO:0006281  DNA repair
GO:0006260  DNA replication
GO:0051260  protein homooligomerization
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent
GO:0006412  translation

Cellular Component

GO:0030424  axon
GO:0005737  cytoplasm
GO:0030426  growth cone
GO:0005634  nucleus
GO:0030529  ribonucleoprotein complex
GO:0032797  SMN complex

Molecular Function

GO:0005524  ATP binding
GO:0043141  ATP-dependent 5'-3' DNA helicase activity
GO:0032575  ATP-dependent 5'-3' RNA helicase activity
GO:0003677  DNA binding
GO:0003678  DNA helicase activity
GO:0008094  DNA-dependent ATPase activity
GO:0005515  protein binding
GO:0043022  ribosome binding
GO:0003723  RNA binding
GO:0008186  RNA-dependent ATPase activity
GO:0003697  single-stranded DNA binding
GO:0008134  transcription factor binding
GO:0000049  tRNA binding
GO:0008270  zinc ion binding