ligase I, DNA, ATP-dependent

同義遺伝子名

Polydeoxyribonucleotide synthase [ATP] 1, MGC130025, LIG1, MGC117397, DNA ligase 1, DNA ligase I, ligase I, DNA, ATP-dependent

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:34.40

小脳:88.20

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:30.70

脊柱:-

網膜:118.60

目:47

動脈:119.90

静脈:-

リンパ節:60.70

末梢血:18.20

脾臓:37.80

胸腺:167.50

骨髄:39.40

脂肪:40.30

骨:12.80

皮膚:28.80

GeneChip

大脳:5.67

小脳:5.72

脳幹:5.93

脳梁:5.83

松果体:-

末梢神経:5.62

脊柱:5.72

網膜:-

目:-

動脈:5.81

静脈:5.58

リンパ節:6.67

末梢血:-

脾臓:6.22

胸腺:7.34

骨髄:7.19

脂肪:5.82

骨:-

皮膚:6.37

CAGE

大脳:2.64

小脳:-

脳幹:2.58

脳梁:2.62

松果体:2.54

末梢神経:-

脊柱:2.87

網膜:-

目:-

動脈:2.22

静脈:3.18

リンパ節:3.24

末梢血:-

脾臓:2.63

胸腺:3.96

骨髄:-

脂肪:1.88

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:1.39

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:1.99

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:1.16

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:18.20

胎盤:58.30

前立腺:45.10

卵巣:37.30

精巣:82.20

心臓:51.10

骨格筋:-

食道:-

胃:42.50

腸:-

結腸:93.30

肝臓:42.20

肺:34.20

膀胱:-

腎臓:10.40

下垂体:116

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:53.30

乳腺:46.50

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.01

胎盤:6.35

前立腺:6.05

卵巣:6.18

精巣:6.84

心臓:5.25

骨格筋:5.53

食道:6.19

胃:5.95

腸:6.13

結腸:6.12

肝臓:5.89

肺:5.91

膀胱:-

腎臓:5.66

下垂体:6.31

甲状腺:6.43

副腎:5.64

膵臓:5.95

乳腺:6.39

唾液腺:5.69

CAGE

子宮:2.66

胎盤:3.06

前立腺:2.31

卵巣:2.48

精巣:2.90

心臓:1.56

骨格筋:1.70

食道:2.42

胃:-

腸:2.73

結腸:2.83

肝臓:1.99

肺:2.47

膀胱:1.71

腎臓:1.96

下垂体:2.56

甲状腺:2.10

副腎:-

膵臓:2.54

乳腺:2.19

唾液腺:2.50

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:1.66

卵巣:2.13

精巣:2.71

心臓:0.49

骨格筋:1.16

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.60

肝臓:0.85

肺:1.50

膀胱:-

腎臓:1.34

下垂体:-

甲状腺:2.20

副腎:2.38

膵臓:-

乳腺:1.32

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_000234
Gene ID	3978
Unigene ID	Hs.1770
Probe set ID	202726_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000105486
GTEx ID	ENSG00000105486

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]	NM_001083188, NM_001199310, NM_010715
ラット[2]	NM_001024268, NM_030855, NM_010715

染色体

19q13.33 [48,618,703 - 48,673,601]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR012310

ATP dependent DNA ligase, central

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0009653	anatomical structure morphogenesis
GO:0006284	base-excision repair
GO:0051301	cell division
GO:0051103	DNA ligation during DNA repair
GO:0006259	DNA metabolic process
GO:0006281	DNA repair
GO:0006271	DNA strand elongation during DNA replication
GO:0006302	double-strand break repair
GO:0000724	double-strand break repair via homologous recombination
GO:0006303	double-strand break repair via nonhomologous end joining
GO:0006273	lagging strand elongation
GO:0000278	mitotic cell cycle
GO:0006289	nucleotide-excision repair
GO:0006297	nucleotide-excision repair, DNA gap filling
GO:0042542	response to hydrogen peroxide
GO:0000723	telomere maintenance
GO:0000722	telomere maintenance via recombination
GO:0032201	telomere maintenance via semi-conservative replication
GO:0006283	transcription-coupled nucleotide-excision repair
GO:0033151	V(D)J recombination

Cellular Component

GO:0005694	chromosome
GO:0005739	mitochondrion
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0005524	ATP binding
GO:0003677	DNA binding
GO:0003910	DNA ligase (ATP) activity
GO:0003909	DNA ligase activity
GO:0046872	metal ion binding

ligase I, DNA, ATP-dependent

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function