ligase III, DNA, ATP-dependent

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同義遺伝子名

LIG3, DNA ligase 3, DNA ligase III, ligase III, DNA, ATP-dependent, Polydeoxyribonucleotide synthase [ATP] 3

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:22.50

小脳:63

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:23.50

動脈:-

静脈:133.30

リンパ節:10.10

末梢血:54.70

脾臓:37.80

胸腺:64.40

骨髄:-

脂肪:40.30

骨:12.80

皮膚:19.20

GeneChip

大脳:4.64

小脳:4.89

脳幹:4.63

脳梁:4.77

松果体:-

末梢神経:4.78

脊柱:4.57

網膜:-

目:-

動脈:4.87

静脈:5.12

リンパ節:4.80

末梢血:-

脾臓:5.07

胸腺:5.22

骨髄:5.38

脂肪:4.75

骨:-

皮膚:4.89

CAGE

大脳:3.24

小脳:-

脳幹:2.92

脳梁:3.38

松果体:2.97

末梢神経:-

脊柱:2.95

網膜:-

目:-

動脈:2.77

静脈:3.02

リンパ節:2.96

末梢血:-

脾臓:3.13

胸腺:3.44

骨髄:-

脂肪:2.88

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:1.50

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:1.98

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.07

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:100.20

胎盤:47.40

前立腺:22.50

卵巣:37.30

精巣:142.80

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:17

肝臓:-

肺:9.80

膀胱:125.60

腎臓:10.40

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:50.80

膵臓:8.90

乳腺:74.30

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.21

胎盤:5.30

前立腺:5.38

卵巣:5.25

精巣:5.34

心臓:4.81

骨格筋:4.84

食道:5.03

胃:4.85

腸:4.84

結腸:4.85

肝臓:4.79

肺:4.92

膀胱:-

腎臓:4.73

下垂体:5.10

甲状腺:5.04

副腎:4.91

膵臓:5.31

乳腺:4.86

唾液腺:4.97

CAGE

子宮:3.40

胎盤:3.31

前立腺:3.30

卵巣:3.47

精巣:3.87

心臓:2.71

骨格筋:3.04

食道:2.97

胃:-

腸:2.81

結腸:2.94

肝臓:2.81

肺:2.78

膀胱:3.16

腎臓:2.54

下垂体:3.32

甲状腺:3.08

副腎:-

膵臓:3.06

乳腺:2.79

唾液腺:3.34

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.89

卵巣:3.14

精巣:2.83

心臓:1.48

骨格筋:2.93

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.13

肝臓:1.81

肺:2.13

膀胱:-

腎臓:2.31

下垂体:-

甲状腺:2.70

副腎:1.99

膵臓:-

乳腺:1.48

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_013975
Gene ID	3980
Unigene ID	Hs.100299
Probe set ID	204123_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000005156
GTEx ID	ENSG00000005156

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]	NM_010716
ラット [0]

染色体

17q12 [33,307,542 - 33,332,083]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR012310

ATP dependent DNA ligase, central

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006284	base-excision repair
GO:0051301	cell division
GO:0051103	DNA ligation during DNA repair
GO:0006281	DNA repair
GO:0006303	double-strand break repair via nonhomologous end joining
GO:0006273	lagging strand elongation
GO:0043504	mitochondrial DNA repair
GO:0045910	negative regulation of DNA recombination
GO:0006289	nucleotide-excision repair
GO:0007131	reciprocal meiotic recombination
GO:0007283	spermatogenesis
GO:0033151	V(D)J recombination

Cellular Component

GO:0005694	chromosome
GO:0005739	mitochondrion
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0000795	synaptonemal complex

Molecular Function

GO:0005524	ATP binding
GO:0003677	DNA binding
GO:0003910	DNA ligase (ATP) activity
GO:0003909	DNA ligase activity
GO:0005515	protein binding
GO:0008270	zinc ion binding

ligase III, DNA, ATP-dependent

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function