LIM homeobox transcription factor 1, beta

同義遺伝子名

LMX1.2, LIM homeobox transcription factor 1 beta, LMX1B, LMX-1.2, MGC142051, LIM-homeobox protein 1.2, LIM homeobox transcription factor 1, beta, NPS1, LIM/homeobox protein LMX1B, MGC138325

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:1.20

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:11.80

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

GeneChip

大脳:4.54

小脳:4.47

脳幹:4.59

脳梁:4.51

松果体:-

末梢神経:4.34

脊柱:4.51

網膜:-

目:-

動脈:4.63

静脈:4.70

リンパ節:4.49

末梢血:-

脾臓:4.34

胸腺:4.34

骨髄:4.67

脂肪:4.60

骨:-

皮膚:4.82

CAGE

大脳:0.01

小脳:-

脳幹:0.19

脳梁:0

松果体:0.26

末梢神経:-

脊柱:0.97

網膜:-

目:-

動脈:0.47

静脈:0.70

リンパ節:0

末梢血:-

脾臓:0

胸腺:0

骨髄:-

脂肪:0.71

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.00

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.11

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.30

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:9.30

唾液腺:-

GeneChip

子宮:4.41

胎盤:4.19

前立腺:4.23

卵巣:4.30

精巣:4.43

心臓:4.80

骨格筋:4.73

食道:4.52

胃:4.47

腸:4.62

結腸:4.68

肝臓:4.79

肺:4.48

膀胱:-

腎臓:4.60

下垂体:4.45

甲状腺:4.52

副腎:4.66

膵臓:4.98

乳腺:4.45

唾液腺:5.40

CAGE

子宮:0.09

胎盤:0

前立腺:0.21

卵巣:0.07

精巣:1.25

心臓:0.83

骨格筋:0.21

食道:0

胃:-

腸:0.21

結腸:0.04

肝臓:0

肺:0.05

膀胱:0.26

腎臓:0.67

下垂体:0.26

甲状腺:0.41

副腎:-

膵臓:0.58

乳腺:2.11

唾液腺:3.57

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.05

卵巣:0.05

精巣:1.13

心臓:0.08

骨格筋:0.03

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.10

肝臓:0.00

肺:0.01

膀胱:-

腎臓:0.93

下垂体:-

甲状腺:0.15

副腎:0.01

膵臓:-

乳腺:0.88

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_002316
Gene ID	4010
Unigene ID	Hs.129133
Probe set ID	208487_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000136944
GTEx ID	ENSG00000136944

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_010725
ラット[1]	NM_010725

染色体

9q33.3 [129,376,722 - 129,463,311]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001356	Homeobox
IPR009057	Homeodomain-like
IPR012287	Homeodomain-related

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0008219	cell death
GO:0008283	cell proliferation
GO:0021954	central nervous system neuron development
GO:0021587	cerebellum morphogenesis
GO:0030199	collagen fibril organization
GO:0009953	dorsal/ventral pattern formation
GO:0001701	in utero embryonic development
GO:0035108	limb morphogenesis
GO:0030901	midbrain development
GO:0007275	multicellular organismal development
GO:0030182	neuron differentiation
GO:0001764	neuron migration
GO:0035265	organ growth
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005634

nucleus

Molecular Function

GO:0005515	protein binding
GO:0043565	sequence-specific DNA binding
GO:0003700	transcription factor activity
GO:0008270	zinc ion binding

LIM homeobox transcription factor 1, beta

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function