lymphotoxin beta (TNF superfamily, member 3)

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同義遺伝子名

lymphotoxin beta (TNF superfamily, member 3), TNF-C, TNFSF3, Lymphotoxin-beta, Tumor necrosis factor C, TNFC, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 3, LTB, LT-beta

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:4.70 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:293.20 末梢血:54.70 脾臓:151.30 胸腺:103.10 骨髄:19.70 脂肪:- 骨:25.60 皮膚:-
GeneChip 大脳:6.08 小脳:6.22 脳幹:6.25 脳梁:5.95 松果体:- 末梢神経:5.55 脊柱:5.65 網膜:- 目:- 動脈:6.13 静脈:6.51 リンパ節:9.93 末梢血:- 脾臓:10.40 胸腺:9.92 骨髄:7.68 脂肪:6.95 骨:- 皮膚:6.56
CAGE 大脳:0.02 小脳:- 脳幹:0.13 脳梁:0 松果体:0 末梢神経:- 脊柱:0 網膜:- 目:- 動脈:1.22 静脈:4.80 リンパ節:4.54 末梢血:- 脾臓:4.63 胸腺:5.22 骨髄:- 脂肪:0.46 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.35 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:5.82 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.13 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:18.20 前立腺:- 卵巣:- 精巣:4.30 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:32.40 結腸:8.50     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.13 胎盤:5.80 前立腺:5.86 卵巣:6.24 精巣:5.42 心臓:6.40 骨格筋:6.28 食道:6.17 胃:7.03 腸:6.58 結腸:7.03 肝臓:6.51 肺:7.12 膀胱:- 腎臓:6.24 下垂体:5.84 甲状腺:6.46 副腎:6.22 膵臓:6.54 乳腺:6.41 唾液腺:6.32
CAGE 子宮:0.57 胎盤:0.59 前立腺:1.16 卵巣:0.92 精巣:0.62 心臓:0.47 骨格筋:0.17 食道:2.10 胃:- 腸:1.95 結腸:1.95     肝臓:1.12    肺:2.16 膀胱:1.58 腎臓:1.61 下垂体:0 甲状腺:0.06 副腎:- 膵臓:1.21 乳腺:0.90 唾液腺:2.50
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.27 卵巣:0.70 精巣:0.32 心臓:0.00 骨格筋:0.30 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.31     肝臓:0.42        肺:2.22    膀胱:- 腎臓:0.86 下垂体:- 甲状腺:0.58 副腎:7.34 膵臓:- 乳腺:0.97 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_009588
Gene ID 4050
Unigene ID Hs.376208
Probe set ID 207339_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000204487
ENSG00000206437
ENSG00000223448
ENSG00000227507
ENSG00000231314
ENSG00000236237
ENSG00000236925
ENSG00000238114
GTEx ID ENSG00000204487
ENSG00000206437
ENSG00000223448
ENSG00000227507
ENSG00000231314
ENSG00000236237
ENSG00000236925
ENSG00000238114

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_008518
ラット[1]  NM_212507

染色体

HSCHR6_MHC_APD  [31,559,653  -  31,561,620]
6p21.33  [31,548,302  -  31,550,299]
HSCHR6_MHC_SSTO  [31,538,275  -  31,540,242]
HSCHR6_MHC_MANN  [31,587,819  -  31,589,786]
HSCHR6_MHC_QBL  [31,538,575  -  31,540,542]
HSCHR6_MHC_MCF  [31,624,641  -  31,626,608]
HSCHR6_MHC_DBB  [31,530,476  -  31,532,443]
HSCHR6_MHC_COX  [31,535,744  -  31,537,711]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR006052  Tumor Necrosis Factor
IPR006053  Tumor necrosis factor alpha/beta/c
IPR002961  Tumour necrosis factor c/lymphotoxin-beta
IPR008983  Tumour necrosis factor-like

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

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15034048
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15248211
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15969671
16702430
17981284
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19115949
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21211989
21248773
22294627
22652080
22742857

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007267  cell-cell signaling
GO:0010467  gene expression
GO:0006955  immune response
GO:0048535  lymph node development
GO:0045084  positive regulation of interleukin-12 biosynthetic process
GO:0007165  signal transduction
GO:0043588  skin development

Cellular Component

GO:0005575  cellular_component
GO:0005615  extracellular space
GO:0016021  integral to membrane

Molecular Function

GO:0005125  cytokine activity
GO:0005102  receptor binding
GO:0005164  tumor necrosis factor receptor binding