methyl-CpG binding domain protein 1

同義遺伝子名

PCM1, RFT, MBD1, Protein containing methyl-CpG-binding domain 1, Methyl-CpG-binding protein MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, CXXC3, methyl-CpG binding domain protein 1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:77

小脳:75.60

脳幹:-

脳梁:87.50

松果体:148.30

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:229.20

動脈:30

静脈:133.30

リンパ節:151.70

末梢血:54.70

脾臓:37.80

胸腺:116

骨髄:19.70

脂肪:-

骨:89.60

皮膚:52.80

GeneChip

大脳:7.07

小脳:6.98

脳幹:6.92

脳梁:6.81

松果体:-

末梢神経:7.05

脊柱:7.02

網膜:-

目:-

動脈:7.29

静脈:6.99

リンパ節:7.69

末梢血:-

脾臓:7.78

胸腺:7.76

骨髄:7.42

脂肪:7.30

骨:-

皮膚:7.73

CAGE

大脳:3.26

小脳:-

脳幹:3.25

脳梁:3.20

松果体:3.13

末梢神経:-

脊柱:2.86

網膜:-

目:-

動脈:2.82

静脈:2.90

リンパ節:2.98

末梢血:-

脾臓:2.66

胸腺:3.08

骨髄:-

脂肪:2.81

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.91

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.77

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:1.58

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:54.70

胎盤:58.30

前立腺:67.60

卵巣:37.30

精巣:268.20

心臓:140.50

骨格筋:20.10

食道:-

胃:63.70

腸:97.20

結腸:33.90

肝臓:21.10

肺:39.10

膀胱:125.60

腎臓:52

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:44.50

乳腺:18.60

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.33

胎盤:7.71

前立腺:7.56

卵巣:7.25

精巣:6.98

心臓:7.08

骨格筋:7.16

食道:7.46

胃:7.43

腸:7.23

結腸:7.29

肝臓:7.26

肺:7.31

膀胱:-

腎臓:7.27

下垂体:7.46

甲状腺:7.58

副腎:7.54

膵臓:7.07

乳腺:7.46

唾液腺:7.15

CAGE

子宮:3.17

胎盤:3.17

前立腺:3.06

卵巣:2.97

精巣:4.55

心臓:2.79

骨格筋:2.86

食道:3.16

胃:-

腸:3.11

結腸:2.92

肝臓:2.98

肺:2.74

膀胱:3.17

腎臓:2.68

下垂体:3.52

甲状腺:3.04

副腎:-

膵臓:3.02

乳腺:2.64

唾液腺:3.22

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:1.84

卵巣:1.18

精巣:0.00

心臓:0.94

骨格筋:2.34

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.56

肝臓:1.33

肺:1.05

膀胱:-

腎臓:1.43

下垂体:-

甲状腺:1.26

副腎:1.98

膵臓:-

乳腺:0.84

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_015844
Gene ID	4152
Unigene ID	Hs.405610
Probe set ID	203353_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000141644
GTEx ID	ENSG00000141644

オーソログ対応遺伝子

マウス[3]	NM_013594
ラット[1]	NM_001011924

染色体

18q21.1 [47,793,887 - 47,808,144]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR016177	DNA-binding, integrase-type
IPR001739	Methyl-CpG DNA binding

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0045892	negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006366	transcription from RNA polymerase II promoter

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0000792	heterochromatin
GO:0016363	nuclear matrix
GO:0016607	nuclear speck
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0003677	DNA binding
GO:0008327	methyl-CpG binding
GO:0005515	protein binding
GO:0003714	transcription corepressor activity
GO:0003700	transcription factor activity
GO:0008270	zinc ion binding

methyl-CpG binding domain protein 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function