Mediterranean fever

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同義遺伝子名

MEFV, MEF, TRIM20, MGC126586, FMF, MGC126560, Marenostrin, Pyrin, Mediterranean fever

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:-

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:54.70

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:19.70

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

GeneChip

nodata

CAGE

大脳:0.42

小脳:-

脳幹:0.80

脳梁:0.43

松果体:0.71

末梢神経:-

脊柱:1.16

網膜:-

目:-

動脈:1.43

静脈:1.29

リンパ節:1.82

末梢血:-

脾臓:3.06

胸腺:0.71

骨髄:-

脂肪:1.57

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.04

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.22

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.91

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:4.30

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

nodata

CAGE

子宮:0.65

胎盤:0.95

前立腺:0.78

卵巣:0.82

精巣:0.43

心臓:1.21

骨格筋:0.66

食道:0.86

胃:-

腸:0.73

結腸:0.51

肝臓:0.84

肺:2.45

膀胱:1.27

腎臓:0.85

下垂体:0.38

甲状腺:1.05

副腎:-

膵臓:0.94

乳腺:0

唾液腺:0

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.15

卵巣:0.04

精巣:0.33

心臓:0.14

骨格筋:0.00

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.05

肝臓:0.14

肺:1.57

膀胱:-

腎臓:0.12

下垂体:-

甲状腺:0.15

副腎:0.24

膵臓:-

乳腺:0.11

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_000243
Gene ID	4210
Unigene ID	Hs.632221
Probe set ID	-
Ensembl ID	ENSG00000103313
GTEx ID	ENSG00000103313

オーソログ対応遺伝子

マウス[3]	NM_001161790, NM_001161791, NM_019453
ラット [0]

染色体

16p13.3 [3,292,027 - 3,306,627]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

LRG_190 [5,001 - 19,600]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001870	B302 (SPRY)-like
IPR003879	Butyrophylin-like
IPR011029	DEATH-like
IPR004020	Pyrin
IPR003877	SPla/RYanodine receptor SPRY
IPR018355	SPla/RYanodine receptor subgroup
IPR000315	Zinc finger, B-box

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006954	inflammatory response
GO:0045087	innate immune response
GO:0050728	negative regulation of inflammatory response
GO:0032691	negative regulation of interleukin-1 beta production
GO:0032695	negative regulation of interleukin-12 production

Cellular Component

GO:0005829	cytosol
GO:0005874	microtubule
GO:0005875	microtubule associated complex
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0003779	actin binding
GO:0008270	zinc ion binding

Mediterranean fever

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function