class II, major histocompatibility complex, transactivator

詳細情報を見る

同義遺伝子名

MHC2TA, C2TA, MHC class II transactivator, CIITA IV, CIITA

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

nodata

GeneChip

大脳:4.12

小脳:4.11

脳幹:4.28

脳梁:4.47

松果体:-

末梢神経:4.29

脊柱:4.32

網膜:-

目:-

動脈:4.20

静脈:4.08

リンパ節:5.15

末梢血:-

脾臓:5.39

胸腺:4.51

骨髄:4.65

脂肪:4.32

骨:-

皮膚:4.21

CAGE

大脳:1.76

小脳:-

脳幹:2.76

脳梁:3.31

松果体:1.14

末梢神経:-

脊柱:3.08

網膜:-

目:-

動脈:2.48

静脈:4.85

リンパ節:4.43

末梢血:-

脾臓:4.22

胸腺:3.12

骨髄:-

脂肪:2.52

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.32

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.57

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.75

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

nodata

GeneChip

子宮:4.17

胎盤:4.12

前立腺:3.99

卵巣:4.68

精巣:3.66

心臓:4.39

骨格筋:4.09

食道:4.21

胃:4.51

腸:4.44

結腸:4.55

肝臓:4.28

肺:4.91

膀胱:-

腎臓:4.30

下垂体:4.01

甲状腺:4.34

副腎:4.51

膵臓:4.52

乳腺:4.36

唾液腺:4.60

CAGE

子宮:2.15

胎盤:1.25

前立腺:2.27

卵巣:1.53

精巣:1.26

心臓:1.75

骨格筋:1.59

食道:2.35

胃:-

腸:1.50

結腸:1.70

肝臓:1.01

肺:2.99

膀胱:2.31

腎臓:1.42

下垂体:1.27

甲状腺:0.79

副腎:-

膵臓:0.94

乳腺:0.55

唾液腺:2.78

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.96

卵巣:0.95

精巣:0.50

心臓:0.56

骨格筋:0.28

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.22

肝臓:0.16

肺:1.97

膀胱:-

腎臓:0.93

下垂体:-

甲状腺:0.35

副腎:2.71

膵臓:-

乳腺:0.99

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_000246
Gene ID	4261
Unigene ID	-
Probe set ID	205101_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000179583
GTEx ID	ENSG00000179583

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_007575
ラット[1]	NM_053529

染色体

16p13.13 [10,971,039 - 11,023,624]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

LRG_49 [5,001 - 52,786]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0019221	cytokine-mediated signaling pathway
GO:0006955	immune response
GO:0060333	interferon-gamma-mediated signaling pathway
GO:0032966	negative regulation of collagen biosynthetic process
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045892	negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0045345	positive regulation of MHC class I biosynthetic process
GO:0045348	positive regulation of MHC class II biosynthetic process
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045893	positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0046677	response to antibiotic
GO:0034341	response to interferon-gamma
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005654	nucleoplasm
GO:0016605	PML body

Molecular Function

GO:0005524	ATP binding
GO:0003677	DNA binding
GO:0044212	DNA regulatory region binding
GO:0005515	protein binding
GO:0008022	protein C-terminus binding
GO:0032403	protein complex binding
GO:0033613	transcription activator binding
GO:0003713	transcription coactivator activity

class II, major histocompatibility complex, transactivator

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function