matrix metallopeptidase 8 (neutrophil collagenase)

同義遺伝子名

HNC, MMP8, PMNL collagenase, Matrix metalloproteinase-8, CLG1, matrix metallopeptidase 8 (neutrophil collagenase), PMNL-CL, MMP-8, Neutrophil collagenase precursor

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:-

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:18.20

脾臓:-

胸腺:12.90

骨髄:177.10

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

GeneChip

大脳:3.83

小脳:3.74

脳幹:3.80

脳梁:3.75

松果体:-

末梢神経:3.81

脊柱:3.79

網膜:-

目:-

動脈:3.73

静脈:3.87

リンパ節:3.81

末梢血:-

脾臓:3.89

胸腺:4.09

骨髄:9.82

脂肪:3.76

骨:-

皮膚:3.67

CAGE

大脳:0.14

小脳:-

脳幹:0.22

脳梁:0.18

松果体:0

末梢神経:-

脊柱:0.13

網膜:-

目:-

動脈:0.59

静脈:0.70

リンパ節:0.69

末梢血:-

脾臓:2.71

胸腺:1.47

骨髄:-

脂肪:0.96

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.13

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:1.03

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.18

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:10.60

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:3.64

胎盤:3.81

前立腺:3.60

卵巣:3.66

精巣:3.69

心臓:3.90

骨格筋:3.93

食道:3.74

胃:3.81

腸:3.80

結腸:5.04

肝臓:3.88

肺:3.72

膀胱:-

腎臓:3.93

下垂体:3.92

甲状腺:3.70

副腎:3.98

膵臓:3.88

乳腺:3.65

唾液腺:4.01

CAGE

子宮:0

胎盤:0.68

前立腺:0

卵巣:0.64

精巣:0.16

心臓:1.31

骨格筋:0.46

食道:0.09

胃:-

腸:0

結腸:0

肝臓:0.36

肺:1.29

膀胱:0.09

腎臓:0

下垂体:0.26

甲状腺:0.90

副腎:-

膵臓:0.58

乳腺:0.55

唾液腺:0.36

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.02

卵巣:0.03

精巣:0.10

心臓:0.06

骨格筋:0.12

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.07

肝臓:0.17

肺:3.47

膀胱:-

腎臓:0.00

下垂体:-

甲状腺:0.02

副腎:0.05

膵臓:-

乳腺:0.12

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_002424
Gene ID	4317
Unigene ID	Hs.161839
Probe set ID	207329_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000118113
GTEx ID	ENSG00000118113

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_008611
ラット [0]

染色体

11q22.2 [102,582,526 - 102,597,781]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR006026

Peptidase, metallopeptidases

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0030574	collagen catabolic process
GO:0022617	extracellular matrix disassembly
GO:0030198	extracellular matrix organization
GO:0006508	proteolysis

Cellular Component

GO:0005576	extracellular region
GO:0005615	extracellular space
GO:0005578	proteinaceous extracellular matrix

Molecular Function

GO:0005509	calcium ion binding
GO:0004222	metalloendopeptidase activity
GO:0004252	serine-type endopeptidase activity
GO:0008270	zinc ion binding

matrix metallopeptidase 8 (neutrophil collagenase)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function