matrix metallopeptidase 13 (collagenase 3)

同義遺伝子名

matrix metallopeptidase 13 (collagenase 3), MMP13, CLG3, Matrix metalloproteinase-13, matrix metalloproteinase 13 (collagenase 3), Collagenase 3 precursor, MMP-13

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:29.60

小脳:-

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:-

末梢神経:61.30

脊柱:-

網膜:-

目:52.90

動脈:-

静脈:-

リンパ節:70.80

末梢血:72.90

脾臓:18.90

胸腺:51.50

骨髄:-

脂肪:80.70

骨:25.60

皮膚:4.80

GeneChip

大脳:3.79

小脳:4.05

脳幹:3.79

脳梁:3.92

松果体:-

末梢神経:3.82

脊柱:3.74

網膜:-

目:-

動脈:3.70

静脈:3.87

リンパ節:3.62

末梢血:-

脾臓:3.61

胸腺:3.74

骨髄:3.79

脂肪:3.71

骨:-

皮膚:3.62

CAGE

大脳:0.00

小脳:-

脳幹:0

脳梁:0

松果体:0

末梢神経:-

脊柱:0

網膜:-

目:-

動脈:1.28

静脈:0.34

リンパ節:0

末梢血:-

脾臓:0

胸腺:0.33

骨髄:-

脂肪:0

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.03

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:63.80

胎盤:29.10

前立腺:33.80

卵巣:74.50

精巣:13

心臓:12.80

骨格筋:20.10

食道:342.80

胃:21.20

腸:32.40

結腸:-

肝臓:-

肺:14.70

膀胱:-

腎臓:20.80

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:26.70

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:3.70

胎盤:3.67

前立腺:3.60

卵巣:3.75

精巣:3.66

心臓:3.82

骨格筋:3.96

食道:3.67

胃:3.80

腸:3.82

結腸:3.85

肝臓:3.66

肺:3.75

膀胱:-

腎臓:3.61

下垂体:4.06

甲状腺:3.67

副腎:3.70

膵臓:4.23

乳腺:3.86

唾液腺:3.73

CAGE

子宮:0.19

胎盤:0

前立腺:0.33

卵巣:0

精巣:0.34

心臓:0

骨格筋:0

食道:0

胃:-

腸:0.14

結腸:0

肝臓:0

肺:0.98

膀胱:0

腎臓:0.08

下垂体:0.80

甲状腺:0

副腎:-

膵臓:0

乳腺:0

唾液腺:0

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.18

卵巣:0

精巣:0.08

心臓:0

骨格筋:0

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0

肝臓:0

肺:2.64

膀胱:-

腎臓:0.01

下垂体:-

甲状腺:0

副腎:0.03

膵臓:-

乳腺:0.16

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_002427
Gene ID	4322
Unigene ID	Hs.293629
Probe set ID	205959_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000137745
GTEx ID	ENSG00000137745

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_008607
ラット[1]	NM_133530

染色体

11q22.2 [102,813,724 - 102,826,463]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR006026

Peptidase, metallopeptidases

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0030282	bone mineralization
GO:0051216	cartilage development
GO:0044267	cellular protein metabolic process
GO:0030574	collagen catabolic process
GO:0022617	extracellular matrix disassembly
GO:0030198	extracellular matrix organization
GO:0006508	proteolysis

Cellular Component

GO:0005576	extracellular region
GO:0005615	extracellular space
GO:0005578	proteinaceous extracellular matrix

Molecular Function

GO:0005509	calcium ion binding
GO:0004222	metalloendopeptidase activity
GO:0008270	zinc ion binding

matrix metallopeptidase 13 (collagenase 3)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function