mutS homolog 2, colon cancer, nonpolyposis type 1 (E. coli)

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同義遺伝子名

HNPCC, DNA mismatch repair protein Msh2, MutS protein homolog 2, COCA1, MSH2, FCC1, HNPCC1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:2.40

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:20.20

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:12.90

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

GeneChip

大脳:5.58

小脳:5.56

脳幹:5.77

脳梁:5.26

松果体:-

末梢神経:5.26

脊柱:5.40

網膜:-

目:-

動脈:4.44

静脈:4.50

リンパ節:5.08

末梢血:-

脾臓:4.90

胸腺:7.02

骨髄:5.71

脂肪:5.04

骨:-

皮膚:4.94

CAGE

大脳:3.06

小脳:-

脳幹:2.91

脳梁:2.34

松果体:4.05

末梢神経:-

脊柱:2.63

網膜:-

目:-

動脈:1.72

静脈:2.33

リンパ節:2.60

末梢血:-

脾臓:2.34

胸腺:3.63

骨髄:-

脂肪:2.10

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.22

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.21

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.44

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:37.30

精巣:-

心臓:12.80

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:17

肝臓:-

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:18.60

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.41

胎盤:4.72

前立腺:5.35

卵巣:5.81

精巣:6.10

心臓:5

骨格筋:4.71

食道:5.27

胃:4.53

腸:4.87

結腸:4.52

肝臓:4.33

肺:4.46

膀胱:-

腎臓:4.65

下垂体:5.13

甲状腺:5.31

副腎:4.67

膵臓:5.09

乳腺:5.37

唾液腺:4.82

CAGE

子宮:2.30

胎盤:2.21

前立腺:2.10

卵巣:1.98

精巣:2.67

心臓:2.10

骨格筋:1.39

食道:1.92

胃:-

腸:1.98

結腸:2.20

肝臓:0.71

肺:1.97

膀胱:1.81

腎臓:1.80

下垂体:2.60

甲状腺:2.44

副腎:-

膵臓:2.08

乳腺:1.36

唾液腺:1.49

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.10

卵巣:2.90

精巣:3.86

心臓:2.24

骨格筋:1.64

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.69

肝臓:1.20

肺:1.78

膀胱:-

腎臓:3.19

下垂体:-

甲状腺:3.18

副腎:2.68

膵臓:-

乳腺:2.70

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_000251
Gene ID	4436
Unigene ID	Hs.597656
Probe set ID	209421_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000095002
GTEx ID	ENSG00000095002

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_008628
ラット [0]

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0030183	B cell differentiation
GO:0019724	B cell mediated immunity
GO:0007050	cell cycle arrest
GO:0008340	determination of adult lifespan
GO:0042771	DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in induction of apoptosis
GO:0006281	DNA repair
GO:0006302	double-strand break repair
GO:0007281	germ cell development
GO:0001701	in utero embryonic development
GO:0031573	intra-S DNA damage checkpoint
GO:0045190	isotype switching
GO:0043570	maintenance of DNA repeat elements
GO:0008584	male gonad development
GO:0006311	meiotic gene conversion
GO:0000710	meiotic mismatch repair
GO:0006298	mismatch repair
GO:0045910	negative regulation of DNA recombination
GO:0043524	negative regulation of neuron apoptosis
GO:0045128	negative regulation of reciprocal meiotic recombination
GO:0006119	oxidative phosphorylation
GO:0051096	positive regulation of helicase activity
GO:0006301	postreplication repair
GO:0010224	response to UV-B
GO:0010165	response to X-ray
GO:0016446	somatic hypermutation of immunoglobulin genes
GO:0016447	somatic recombination of immunoglobulin gene segments

Cellular Component

GO:0032301	MutSalpha complex
GO:0032302	MutSbeta complex
GO:0000228	nuclear chromosome

Molecular Function

GO:0043531	ADP binding
GO:0005524	ATP binding
GO:0016887	ATPase activity
GO:0019237	centromeric DNA binding
GO:0032139	dinucleotide insertion or deletion binding
GO:0032181	dinucleotide repeat insertion binding
GO:0003677	DNA binding
GO:0008094	DNA-dependent ATPase activity
GO:0000406	double-strand/single-strand DNA junction binding
GO:0003690	double-stranded DNA binding
GO:0019899	enzyme binding
GO:0000400	four-way junction DNA binding
GO:0032137	guanine/thymine mispair binding
GO:0000404	loop DNA binding
GO:0000287	magnesium ion binding
GO:0030983	mismatched DNA binding
GO:0032405	MutLalpha complex binding
GO:0032357	oxidized purine DNA binding
GO:0005515	protein binding
GO:0008022	protein C-terminus binding
GO:0042803	protein homodimerization activity
GO:0019901	protein kinase binding
GO:0032142	single guanine insertion binding
GO:0032143	single thymine insertion binding
GO:0003697	single-stranded DNA binding
GO:0000403	Y-form DNA binding

mutS homolog 2, colon cancer, nonpolyposis type 1 (E. coli)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function