mutS homolog 3 (E. coli)

同義遺伝子名

mutS (E. coli) homolog 3, Mismatch repair protein 1, Divergent upstream protein, DUG, DUC1, mutS homolog 3 (E. coli), MSH3, DNA mismatch repair protein Msh3

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:8.30

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:30.70

脊柱:112.30

網膜:-

目:29.40

動脈:30

静脈:66.60

リンパ節:10.10

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:78.70

脂肪:-

骨:-

皮膚:43.20

GeneChip

大脳:5.64

小脳:5.65

脳幹:5.60

脳梁:5.66

松果体:-

末梢神経:5.57

脊柱:5.70

網膜:-

目:-

動脈:5.55

静脈:5.38

リンパ節:5.58

末梢血:-

脾臓:5.57

胸腺:5.78

骨髄:5.48

脂肪:5.36

骨:-

皮膚:5.58

CAGE

大脳:3.06

小脳:-

脳幹:2.81

脳梁:2.94

松果体:3.06

末梢神経:-

脊柱:3.00

網膜:-

目:-

動脈:3.05

静脈:3.10

リンパ節:3.00

末梢血:-

脾臓:2.82

胸腺:3.40

骨髄:-

脂肪:3.12

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:2.11

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:1.76

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.10

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:10.90

前立腺:45.10

卵巣:-

精巣:17.30

心臓:-

骨格筋:20.10

食道:-

胃:21.20

腸:32.40

結腸:25.40

肝臓:10.60

肺:-

膀胱:-

腎臓:52

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:26.70

乳腺:74.30

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.62

胎盤:5.12

前立腺:5.66

卵巣:5.86

精巣:5.57

心臓:5.50

骨格筋:5.15

食道:5.48

胃:5.48

腸:5.31

結腸:5.41

肝臓:5.63

肺:5.59

膀胱:-

腎臓:5.74

下垂体:5.57

甲状腺:5.79

副腎:5.62

膵臓:5.23

乳腺:5.60

唾液腺:5.48

CAGE

子宮:3.24

胎盤:2.74

前立腺:2.95

卵巣:2.88

精巣:2.85

心臓:3.10

骨格筋:2.92

食道:2.97

胃:-

腸:3.09

結腸:2.99

肝臓:2.61

肺:3.34

膀胱:2.48

腎臓:2.94

下垂体:3.00

甲状腺:2.84

副腎:-

膵臓:3.20

乳腺:3.56

唾液腺:2.66

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.32

卵巣:2.49

精巣:2.49

心臓:1.55

骨格筋:2.18

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.09

肝臓:1.88

肺:1.89

膀胱:-

腎臓:2.34

下垂体:-

甲状腺:2.48

副腎:1.52

膵臓:-

乳腺:2.95

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_002439
Gene ID	4437
Unigene ID	Hs.280987
Probe set ID	205887_x_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000113318
GTEx ID	ENSG00000113318

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_010829
ラット [0]

染色体

5q14.1 [79,950,467 - 80,172,631]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000432

DNA mismatch repair protein MutS, C-terminal

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006281	DNA repair
GO:0043570	maintenance of DNA repeat elements
GO:0000710	meiotic mismatch repair
GO:0006298	mismatch repair
GO:0045910	negative regulation of DNA recombination
GO:0051096	positive regulation of helicase activity
GO:0007131	reciprocal meiotic recombination
GO:0016447	somatic recombination of immunoglobulin gene segments

Cellular Component

GO:0032302	MutSbeta complex
GO:0000228	nuclear chromosome
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0005524	ATP binding
GO:0019237	centromeric DNA binding
GO:0032139	dinucleotide insertion or deletion binding
GO:0032181	dinucleotide repeat insertion binding
GO:0008094	DNA-dependent ATPase activity
GO:0000406	double-strand/single-strand DNA junction binding
GO:0019899	enzyme binding
GO:0032137	guanine/thymine mispair binding
GO:0000404	loop DNA binding
GO:0030983	mismatched DNA binding
GO:0032357	oxidized purine DNA binding
GO:0005515	protein binding
GO:0042803	protein homodimerization activity
GO:0032142	single guanine insertion binding
GO:0003697	single-stranded DNA binding
GO:0000403	Y-form DNA binding

mutS homolog 3 (E. coli)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function