mutS homolog 5 (E. coli)

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同義遺伝子名

mutS (E. coli) homolog 5, MutS protein homolog 5, DKFZp434C1615, MSH5, G7, MGC2939, mutS homolog 5 (E. coli), MutSH5, NG23

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:- 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip 大脳:3.85 小脳:3.72 脳幹:3.83 脳梁:3.97 松果体:- 末梢神経:3.94 脊柱:3.95 網膜:- 目:- 動脈:4.26 静脈:4.09 リンパ節:4.69 末梢血:- 脾臓:4.61 胸腺:5.10 骨髄:5.10 脂肪:4.42 骨:- 皮膚:4.75
CAGE 大脳:1.91 小脳:- 脳幹:1.94 脳梁:2.53 松果体:1.10 末梢神経:- 脊柱:2.21 網膜:- 目:- 動脈:1.97 静脈:2.47 リンパ節:2.33 末梢血:- 脾臓:2.12 胸腺:2.82 骨髄:- 脂肪:1.88 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.00 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.00 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.08 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:4.43 胎盤:4.05 前立腺:4.83 卵巣:4.33 精巣:6.05 心臓:3.79 骨格筋:3.80 食道:4.45 胃:4.43 腸:4.21 結腸:4.19 肝臓:4.44 肺:4.18 膀胱:- 腎臓:4.60 下垂体:4.23 甲状腺:4.22 副腎:3.99 膵臓:4.39 乳腺:4.51 唾液腺:4.19
CAGE 子宮:2.52 胎盤:1.64 前立腺:2.07 卵巣:2.01 精巣:2.88 心臓:1.28 骨格筋:1.28 食道:2.04 胃:- 腸:2.03 結腸:2.36     肝臓:1.12    肺:2.18 膀胱:1.68 腎臓:2.13 下垂体:2.40 甲状腺:1.32 副腎:- 膵臓:0.94 乳腺:1.53 唾液腺:2.31
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.22 卵巣:0.15 精巣:0.82 心臓:0 骨格筋:0.00 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.08     肝臓:0.03        肺:0.40    膀胱:- 腎臓:0 下垂体:- 甲状腺:0 副腎:0.44 膵臓:- 乳腺:0.09 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_025259
Gene ID 4439
Unigene ID Hs.647011
Probe set ID 210410_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000204410
ENSG00000227314
GTEx ID ENSG00000204410
ENSG00000227314

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]  NM_001146215, NM_013600
ラット[1]  NM_212536, NM_013600

染色体

HSCHR6_MHC_APD  [31,735,723  -  31,743,982]
HSCHR6_MHC_QBL  [31,698,009  -  31,719,779]
HSCHR6_MHC_COX  [31,695,130  -  31,720,005]
HSCHR6_MHC_MANN  [31,747,261  -  31,754,696]
HSCHR6_MHC_SSTO  [31,697,728  -  31,720,408]
6p21.33  [31,707,725  -  31,732,622]
HSCHR6_MHC_MCF  [31,784,012  -  31,808,928]
HSCHR6_MHC_DBB  [31,689,902  -  31,714,813]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000432  DNA mismatch repair protein MutS, C-terminal

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

2477242
8812450
9740671
9787078
9916805
10029069
12477932
12591739
14574404
14656967
14702039
14718574
15304223
15489334
15907804
16122992
16397227
16712791
17127347
17409188
17672918
17869244
17977839
18166824
18204446
18270339
18459961
18978787
19143814
19143821
19442657
19808033
19851445
20185565
20378615
20542071
20587610
20848568
21906983
22401567
22917773
24023853
24250222

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0051026  chiasma formation
GO:0045143  homologous chromosome segregation
GO:0007126  meiosis
GO:0000710  meiotic mismatch repair
GO:0007136  meiotic prophase II
GO:0006298  mismatch repair
GO:0007131  reciprocal meiotic recombination

Cellular Component

GO:0032300  mismatch repair complex
GO:0000795  synaptonemal complex

Molecular Function

GO:0005524  ATP binding
GO:0003684  damaged DNA binding
GO:0008094  DNA-dependent ATPase activity
GO:0030983  mismatched DNA binding