msh homeobox 1

同義遺伝子名

Msh homeobox 1-like protein, Homeobox protein MSX-1, Hox-7, HOX7, msh homeo box homolog 1 (Drosophila), HYD1, msh homeobox homolog 1 (Drosophila), MSX1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:15.40

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:5.90

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:18.90

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:4.80

GeneChip

大脳:5.28

小脳:5.09

脳幹:4.94

脳梁:5.71

松果体:-

末梢神経:5.02

脊柱:5.81

網膜:-

目:-

動脈:5.86

静脈:7.49

リンパ節:4.90

末梢血:-

脾臓:5.19

胸腺:4.24

骨髄:4.82

脂肪:5.88

骨:-

皮膚:5.71

CAGE

大脳:1.58

小脳:-

脳幹:1.66

脳梁:2.36

松果体:1.62

末梢神経:-

脊柱:1.88

網膜:-

目:-

動脈:1.85

静脈:1.86

リンパ節:1.05

末梢血:-

脾臓:1.89

胸腺:0.18

骨髄:-

脂肪:2.15

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:1.32

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.57

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.47

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:118.50

胎盤:21.90

前立腺:56.30

卵巣:-

精巣:-

心臓:63.90

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:10.60

肺:9.80

膀胱:-

腎臓:20.80

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:8.39

胎盤:5.50

前立腺:5.06

卵巣:5.10

精巣:4.44

心臓:5.65

骨格筋:5.05

食道:5.26

胃:4.83

腸:4.79

結腸:4.90

肝臓:4.53

肺:5.30

膀胱:-

腎臓:4.96

下垂体:6.65

甲状腺:5.36

副腎:5.48

膵臓:5.44

乳腺:5.45

唾液腺:4.63

CAGE

子宮:3.54

胎盤:1.25

前立腺:2.07

卵巣:1.71

精巣:0.85

心臓:1.99

骨格筋:0.70

食道:1.29

胃:-

腸:0.53

結腸:0.49

肝臓:0.14

肺:0.88

膀胱:2.38

腎臓:0.54

下垂体:2.46

甲状腺:1.78

副腎:-

膵臓:0.58

乳腺:2.95

唾液腺:0.36

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.34

卵巣:1.37

精巣:1.37

心臓:1.15

骨格筋:0.68

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.01

肝臓:0.14

肺:2.49

膀胱:-

腎臓:0.55

下垂体:-

甲状腺:1.50

副腎:1.49

膵臓:-

乳腺:2.66

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_002448
Gene ID	4487
Unigene ID	Hs.424414
Probe set ID	205932_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000163132
GTEx ID	ENSG00000163132

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_010836
ラット [0]

染色体

4p16.2 [4,861,393 - 4,865,663]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001356	Homeobox
IPR009057	Homeodomain-like
IPR012287	Homeodomain-related

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0009952	anterior/posterior pattern formation
GO:0030262	apoptotic nuclear changes
GO:0060349	bone morphogenesis
GO:0060536	cartilage morphogenesis
GO:0000902	cell morphogenesis
GO:0035115	embryonic forelimb morphogenesis
GO:0035116	embryonic hindlimb morphogenesis
GO:0003198	epithelial to mesenchymal transition involved in endocardial cushion formation
GO:0060325	face morphogenesis
GO:0030900	forebrain development
GO:0001701	in utero embryonic development
GO:0010463	mesenchymal cell proliferation
GO:0030901	midbrain development
GO:0042474	middle ear morphogenesis
GO:0007517	muscle organ development
GO:0043066	negative regulation of apoptosis
GO:0030308	negative regulation of cell growth
GO:0008285	negative regulation of cell proliferation
GO:0051154	negative regulation of striated muscle cell differentiation
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0042475	odontogenesis of dentine-containing tooth
GO:0060021	palate development
GO:0030513	positive regulation of BMP signaling pathway
GO:0043517	positive regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0034504	protein localization in nucleus
GO:0050821	protein stabilization
GO:0042481	regulation of odontogenesis

Cellular Component

GO:0005634	nucleus
GO:0005667	transcription factor complex

Molecular Function

GO:0002039	p53 binding
GO:0043565	sequence-specific DNA binding

msh homeobox 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function